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Enregistrement W2945607155 · doi:10.1016/j.omto.2019.05.004

Assessing the Completeness of Reporting in Preclinical Oncolytic Virus Therapy Studies

2019· article· en· W2945607155 sur OpenAlexafffund
Dean Fergusson, Neil Wesch, Garvin J. Leung, Jenna MacNeil, Isidora Conic, Justin Presseau, Kelly D. Cobey, Jean‐Simon Diallo, Rebecca C. Auer, Jonathan Kimmelman, Natasha Kekre, Nader El-Sayes, Ramya Krishnan, Brian A. Keller, Carolina S. Ilkow, Manoj M. Lalu

Notice bibliographique

RevueMolecular Therapy — Oncolytics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensMcGill UniversityOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesU.S. Food and Drug AdministrationGovernment of Canada
Mots-clésMedicinePreclinical researchOncolytic virusBlindingInclusion and exclusion criteriaMEDLINEPreclinical testingMedical physicsClinical study designClinical trialOncologyPathologyInternal medicineAlternative medicineCancerBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Irreproducibility of preclinical findings could be a significant barrier to the "bench-to-bedside" development of oncolytic viruses (OVs). A contributing factor is the incomplete and non-transparent reporting of study methodology and design. Using the NIH Principles and Guidelines for Reporting Preclinical Research, a core set of seven recommendations, we evaluated the completeness of reporting of preclinical OV studies. We also developed an evidence map identifying the current trends in OV research. A systematic search of MEDLINE and Embase identified all relevant articles published over an 18 month period. We screened 1,554 articles, and 236 met our a priori -defined inclusion criteria. Adenovirus (43%) was the most commonly used viral platform. Frequently investigated cancers included colorectal (14%), skin (12%), and breast (11%). Xenograft implantation (61%) in mice (96%) was the most common animal model. The use of preclinical reporting guidelines was listed in 0.4% of articles. Biological and technical replicates were completely reported in 1% of studies, statistics in 49%, randomization in 1%, blinding in 2%, sample size estimation in 0%, and inclusion/exclusion criteria in 0%. Overall, completeness of reporting in the preclinical OV therapy literature is poor. This may hinder efforts to interpret, replicate, and ultimately translate promising preclinical OV findings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,486
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,731
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,514
Score d'incertitude au seuil0,634

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,4860,731
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,006
Bibliométrie0,0190,013
Études des sciences et des technologies0,0030,004
Communication savante0,0070,006
Science ouverte0,0040,006
Intégrité de la recherche0,0040,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,166
Tête enseignante GPT0,472
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
DomainePrésentation des résultats
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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