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Enregistrement W294570519 · doi:10.4049/jimmunol.186.supp.113.4

Transcription regulation of human NCR1/NKp46, an activating NK cell receptor (113.4)

2011· article· en· W294570519 sur OpenAlexaff
Chiehmin Benjamin Lai, Grace H.W. Cheng, Annie Moradian, Gregg B. Morin, Dixie L. Mager

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensTerry Fox Research InstituteBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyChromatin immunoprecipitationEpigeneticsTranscription factorChromatinCell biologyHistoneDNA methylationGeneGene expressionPromoterMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Natural Killer (NK) lymphocytes are innate immune cells, mainly known to eliminate cancerous and virus infected cells. The NCR1/NKp46 receptor is expressed specifically in the NK lineage. Activation of NK effector functions results when the receptor binds viral haemagglutinin or unidentified tumor ligands. Knockout studies have shown that the molecule is indispensible in the control of influenza infection, lymphoma growth, and the development of type I diabetes. Yet the molecular basis behind the specificity of NCR1 expression is unknown. We seek to uncover the genetic and epigenetic mechanisms that regulate human NCR1 transcription. Comparative genomics and transient luciferase assays suggest that crucial cis-regulatory elements are found within 300bp upstream of the gene. Within this proximal region, luciferase experiments also indicate the presence of a basal, non-specific promoter as well as a tissue-specific regulatory switch. Through bioinformatics and transcription factor RNA expression screens, RUNX3 was identified as a probable regulator of the switch. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) studies were conducted to confirm RUNX3 binding in NK cells. A proteomics approach is currently underway to identify additional factors. Finally, preliminary ChIP data hints at transcriptional control by histone 3 lysine 4 methylation in blood lineages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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