Transcription regulation of human NCR1/NKp46, an activating NK cell receptor (113.4)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Natural Killer (NK) lymphocytes are innate immune cells, mainly known to eliminate cancerous and virus infected cells. The NCR1/NKp46 receptor is expressed specifically in the NK lineage. Activation of NK effector functions results when the receptor binds viral haemagglutinin or unidentified tumor ligands. Knockout studies have shown that the molecule is indispensible in the control of influenza infection, lymphoma growth, and the development of type I diabetes. Yet the molecular basis behind the specificity of NCR1 expression is unknown. We seek to uncover the genetic and epigenetic mechanisms that regulate human NCR1 transcription. Comparative genomics and transient luciferase assays suggest that crucial cis-regulatory elements are found within 300bp upstream of the gene. Within this proximal region, luciferase experiments also indicate the presence of a basal, non-specific promoter as well as a tissue-specific regulatory switch. Through bioinformatics and transcription factor RNA expression screens, RUNX3 was identified as a probable regulator of the switch. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) studies were conducted to confirm RUNX3 binding in NK cells. A proteomics approach is currently underway to identify additional factors. Finally, preliminary ChIP data hints at transcriptional control by histone 3 lysine 4 methylation in blood lineages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».