MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2945897619 · doi:10.3389/fimmu.2019.01062

Immune Correlates of Disease Progression in Linked HIV-1 Infection

2019· article· en· W2945897619 sur OpenAlexafffund
Michael Tuen, Jude Bimela, Andrew N. Banin, Shilei Ding, Gordon W. Harkins, Svenja Weiß, Vincenza Itri, Allison R. Durham, Stephen F. Porcella, Sonal Soni, Luzia Mayr, Josephine Meli, Judith Torimiro, Marcel Tongo, Xiaohong Wang, Xiang‐Peng Kong, Arthur Nádas, Daniel E. Kaufmann, Zabrina L. Brumme, Aubin Nanfack, Thomas C. Quinn, Susan Zolla‐Pazner, Andrew D. Redd, Andrés Finzi, Miroslaw K. Górny, Phillipe N. Nyambi, Ralf Duerr

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalSimon Fraser UniversityUniversité de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BCFogarty International CenterCanada Excellence Research Chairs, Government of CanadaNHLBI Division of Intramural ResearchYork UniversityNational Institutes of HealthDelta Research and Educational FoundationNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesDivision of Intramural Research, National Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésAntibody-dependent cell-mediated cytotoxicityVaccine trialImmunologyAntibodyImmune systemBiologyVirologyEpitopeHIV vaccineMonoclonal antibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic and immunologic analyses of epidemiologically-linked HIV transmission enable insights into the impact of immune responses on clinical outcomes. Human vaccine trials and animal studies of HIV-1 infection have suggested immune correlates of protection, however, their role in natural infection in terms of protection from disease progression is mostly unknown. Four HIV-1+ Cameroonian individuals, three of them epidemiologically-linked in a polygamous heterosexual relationship and one incidence-matched case, were studied over 15 years for heterologous and cross-neutralizing antibody responses, antibody binding, IgA/IgG levels, antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC), viral evolution, Env epitopes, and host factors including HLA-I alleles. Despite viral infection with related strains, the members of the transmission cluster experienced contrasting clinical outcomes including cases of rapid progression and long-term non-progression in the absence of strongly protective HLA-I or CCR5Δ32 alleles. Slower progression and higher CD4/CD8 ratios were associated with enhanced IgG antibody binding to native Env and stronger V1V2 antibody binding responses in the presence of viruses with residue K169 in V2. ADCC against cells expressing native CD4-exposed Env in combination with low Env-specific IgA/IgG ratios correlated with better clinical outcome. This data set highlights for the first time that V1V2-directed antibody responses and ADCC in the presence of low plasma IgA/IgG ratios can correlate with clinical outcome in natural infection. These parameters are comparable to the major correlates of protection, identified post-hoc in the RV144 vaccine trial; thus they may also modulate the rate of clinical progression once infected. The observation that ADCC against cells expressing CD4-exposed Env more strongly correlated with delayed disease progression compared with ADCC against cells expressing wild-type Env suggests a vital role for antibodies targeting open Env conformations in protective antibody-mediated immune responses in natural infection. The findings illustrate the potential of immune correlate analysis in natural infection to guide vaccine development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in ImmunologyMême sujetHIV Research and TreatmentTravaux en français237 207