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Enregistrement W2945915849 · doi:10.1097/pas.0000000000001273

Microsecretory Adenocarcinoma

2019· article· en· W2945915849 sur OpenAlexaff
Justin A. Bishop, Ilan Weinreb, David Swanson, William H. Westra, Hina Qureshi, James J. Sciubba, Christina MacMillan, Lisa M. Rooper, Brendan C. Dickson

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSalivary Gland Tumors Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMount Sinai HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAdenocarcinomaPathologySalivary glandBiologyStromaFusion geneMyoepithelial cellParotid glandEosinophilicImmunohistochemistryCancerMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Salivary gland adenocarcinoma not otherwise specified (NOS) is a heterogenous group, likely containing distinct tumors not yet characterized. A growing number of low to intermediate-grade salivary carcinomas are now known to harbor tumor-specific gene fusions. On occasion, identifying a novel fusion allows for recognition of a new salivary tumor type, in addition to representing a potential diagnostic tool. We sought to characterize a distinctive salivary gland adenocarcinoma that would previously have been regarded as adenocarcinoma NOS. On the basis of the recognition of 5 morphologically identical, distinct low-grade salivary adenocarcinomas, we used targeted RNA sequencing (RNA-Seq) to determine whether these could be differentiated from other fusion-associated salivary gland tumors. RNA-Seq was performed on all 5 low-intermediate grade adenocarcinomas NOS with near-identical histologic appearances, as well as 23 low-intermediate grade control adenocarcinoma NOS cases that did not resemble the index cases. All 5 index cases harbored a novel MEF2C-SS18 gene fusion, which was independently confirmed by reverse transcriptase-polymerase chain reaction. The MEF2C-SS18-positive cases arose in the oral cavity (4/5) and parotid gland (1/5) of 3 women and 2 men ranging from 21 to 80 years (mean: 46) and shared near-identical histologic features: intercalated duct-like cells with eosinophilic to clear cytoplasm and small, uniform oval nuclei, infiltrative microcysts and cords, abundant intraluminal secretions, and cellular fibromyxoid stroma. Mitotic rates were low; necrosis was absent. All MEF2C-SS18-positive tumors were positive for S100 and p63 and negative for p40, smooth muscle actin, calponin, and mammaglobin. One of the 23 control cases, a parotid tumor, was found to contain a SS18-ZBTB7A gene fusion; it demonstrated similar, but not identical histologic and immunophenotypic features compared with the MEF2C-SS18 cases. The remaining control cases were negative for SS18 and MEF2C rearrangements. A novel MEF2C-SS18 gene fusion and unique histologic and immunophenotypic features characterize a heretofore undefined low-grade salivary adenocarcinoma for which we propose the term "microsecretory adenocarcinoma." RNA-Seq helped establish this entity as a distinct tumor type, and identified one possibly related case with a different SS18-related fusion. The recognition of microsecretory adenocarcinoma and its separation from other adenocarcinomas NOS will facilitate a more complete understanding of the clinical and pathologic characteristics of this previously unrecognized neoplasm.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations99
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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