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Enregistrement W2946233444 · doi:10.1002/ece3.5253

Contingency rules for pathogen competition and antagonism in a genetically based, plant defense hierarchy

2019· article· en· W2946233444 sur OpenAlexaff
Posy E. Busby, Gregory M. Crutsinger, Matthew A. Barbour, George Newcombe

Notice bibliographique

RevueEcology and Evolution · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Parasitism and Resistance
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBiological and Environmental ResearchNational Institute of Food and AgricultureNational Science Foundation
Mots-clésAntagonismContingencyCompetition (biology)BiologyHierarchyPlant defense against herbivoryGenetically engineeredGenetically modified organismBiotechnologyEcologyGeneticsEconomicsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Plant defense against pathogens includes a range of mechanisms, including, but not limited to, genetic resistance, pathogen‐antagonizing endophytes, and pathogen competitors. The relative importance of each mechanism can be expressed in a hierarchical view of defense. Several recent studies have shown that pathogen antagonism is inconsistently expressed within the plant defense hierarchy. Our hypothesis is that the hierarchy is governed by contingency rules that determine when and where antagonists reduce plant disease severity. Here, we investigated whether pathogen competition influences pathogen antagonism using Populus as a model system. In three independent field experiments, we asked whether competition for leaf mesophyll cells between a Melampsora rust pathogen and a microscopic, eriophyid mite affects rust pathogen antagonism by fungal leaf endophytes. The rust pathogen has an annual, phenological disadvantage in competition with the mite because the rust pathogen must infect its secondary host in spring before infecting Populus . We varied mite–rust competition by utilizing Populus genotypes characterized by differential genetic resistance to the two organisms. We inoculated plants with endophytes and allowed mites and rust to infect plants naturally. Two contingency rules emerged from the three field experiments: (a) Pathogen antagonism by endophytes can be preempted by host genes for resistance that suppress pathogen development, and (b) pathogen antagonism by endophytes can secondarily be preempted by competitive exclusion of the rust by the mite. Synthesis : Our results point to a Populus defense hierarchy with resistance genes on top, followed by pathogen competition, and finally pathogen antagonism by endophytes. We expect these rules will help to explain the variation in pathogen antagonism that is currently attributed to context dependency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,302
Score d'incertitude au seuil0,111

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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