Melatonin receptor 1A (MTNR1A) gene polymorphisms in the local goat population in South Sulawesi region of Indonesia
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Some important genes are involved in controlling the reproductive trait of goats, one of which is the Melatonin Receptor 1A (MTNR1A) gene. The MTNR1A gene is known with seasonal reproductive activity and related to lambing frequency in the goat. The purpose of this research was to determine the genetic polymorphisms of the MTNR1A gene in Kacang, and Peranakan Ottawa (PE) goat population reared traditionally in South Sulawesi region of Indonesia. In total 253 heads of goat consist of 137 heads of Kacang and 116 Peranakan Ottawa from South, Sulawesi region was used as research samples for blood collection. The blood samples were collected from the jugular vein, which was then continued for DNA extracted by using a DNA extraction kit. The MTNR1A genotype was identified by PCR-RFLP technique using restriction enzyme RsaI. The result showed that there was genetic diversity in the MTNR1A gene in Kacang and PE population with the obtained of two alleles R and r. The common allele was R with frequency 0.93 in Kacang population while in PE population was 0.89. The r allele was 0.06 and 0.10 in Kacang and PE population, respectively. The most common genotype found in the population was RR (0.95), while Rr was only 0.05 and rr genotype did not found in this population. Observed heterozygosity value was 0.05. According to the Hardy-Weinberg test, this population was in equilibrium for MTNR1A gene. In conclusion, this finding indicated that there was genetic diversity exists in local goat population, and future research needed to find any association with this genetic variation with reproductive performance, the data obtained from this study could be used for the strategic program in goat breeding to increase reproductive performance of local goat especially fertility traits.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».