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Enregistrement W2946518384 · doi:10.1002/gcc.22767

The histologic spectrum of soft tissue spindle cell tumors with <i>NTRK3</i> gene rearrangements

2019· article· en· W2946518384 sur OpenAlexaff
Albert J.H. Suurmeijer, Brendan C. Dickson, David Swanson, Lei Zhang, Yun‐Shao Sung, Hsuan‐Ying Huang, Christopher D.�M. Fletcher, Cristina R. Antonescu

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSoft tissue tumor case studies
Établissements canadiensMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNIH Clinical CenterNational Cancer Institute
Mots-clésBiologyImmunohistochemistryETV6Fluorescence in situ hybridizationCD34PathologyDermatofibrosarcoma protuberansHistologyFusion geneGene rearrangementCancer researchChromosomal translocationMedicineGeneChromosomeImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

NTRK3-rearranged tumors other than infantile fibrosarcomas (IFSs) harboring the canonical ETV6-NTRK3 fusions are uncommon, and include mainly inflammatory myofibroblastic tumors and gastrointestinal stromal tumors. Herein, we describe an additional subset of seven tumors sharing NTRK3 gene rearrangements. The cohort included five females and two males (age range 1-67 years). Tumors were located in extremities, trunk, retroperitoneum, or intra-abdominal. In all tumors, fluorescence in situ hybridization (FISH) revealed rearrangements in NTRK3 accompanied by NTRK3 amplification in two cases. In three cases, RNA sequencing identified a fusion transcript composed of NTRK3 exon 14 fused to ETV6, TFG, and TPM4, respectively, retaining the NTRK3 kinase domain. All tumors were positive for pan-TRK by immunohistochemistry (IHC). Two cases showed low- to intermediate-grade histology composed of monomorphic spindle cells arranged in a patternless architecture, stromal bands, and perivascular rings of hyalinized collagen and coexpression of S100 and CD34. The remaining five cases were high-grade fascicular monomorphic spindle cell sarcomas, morphologically somewhat reminiscent of either malignant peripheral nerve sheath tumors (MPNSTs) or fibrosarcomas (FSs). Two high-grade NTRK3 sarcomas showed aggressive clinical behavior with development of lung metastases. Identification of high-grade NTRK3-rearranged sarcomas is clinically important, since the development of selective NTRK inhibitors has opened new avenues for targeted therapy. Although IHC for pan-TRK can be applied as a screening tool, molecular studies are recommended for a conclusive diagnosis of NTRK-rearranged neoplasms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations113
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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