Prevalence, distribution, and diversity of cryptic piroplasm infections in raccoons from selected areas of the United States and Canada
Notice bibliographique
Résumé
The order Piroplasmida contains a diverse group of intracellular parasites, many of which can cause significant disease in humans, domestic animals, and wildlife. Two piroplasm species have been reported from raccoons (Procyon lotor), Babesia lotori (Babesia sensu stricto clade) and a species related to Babesia microti (called B. microti-like sp.). The goal of this study was to investigate prevalence, distribution, and diversity of Babesia in raccoons. We tested raccoons from selected regions in the United States and Canada for the presence of Babesia sensu stricto and Babesia microti-like sp. piroplasms. Infections of Babesia microti-like sp. were found in nearly all locations sampled, often with high prevalence, while Babesia sensu stricto infections had higher prevalence in the Southeastern United States (20–45% prevalence). Co-infections with both Babesia sp. were common. Sequencing of the partial 18S rRNA and cytochrome oxidase subunit 1 (cox1) genes led to the discovery of two new Babesia species, both found in several locations in the eastern and western United States. One novel Babesia sensu stricto sp. was most similar to Babesia gibsoni while the other Babesia species was present in the ‘western piroplasm’ group and was related to Babesia conradae. Phylogenetic analysis of the cox1 sequences indicated possible eastern and western genetic variants for the three Babesia sensu stricto species. Additional analyses are needed to characterize these novel species; however, this study indicates there are now at least four species of piroplasms infecting raccoons in the United States and Canada (Babesia microti-like sp., Babesia lotori, a novel Babesia sensu stricto sp., a novel western Babesia sp.) and a possible fifth species (Babesia sensu stricto) in raccoons in Japan.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».