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Enregistrement W2946764263 · doi:10.1186/s12969-019-0324-7

Periodic fever syndromes: beyond the single gene paradigm

2019· review· en· W2946764263 sur OpenAlexafffundabout
Clara Westwell‐Roper, Iwona Niemietz, Lori B. Tucker, Kelly L. Brown

Notice bibliographique

RevuePediatric Rheumatology · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammasome and immune disorders
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUniversity of British ColumbiaMichael Smith Health Research BCBC Children's Hospital
Mots-clésMEFVFamilial Mediterranean feverDiseaseMedicineGeneticsPhenotypeGeneAlleleEpigeneticsGenotype-phenotype distinctionBioinformaticsBiologyMutationGene mutationInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Familial Mediterranean fever (FMF) is the most common monogenic autoinflammatory disease in Canada and is characterized by a clinical syndrome of episodic inflammatory symptoms. Traditionally, the disease is defined by autosomal recessive inheritance of MEFV gene variants, yet FMF also not uncommonly manifests in individuals with only one identified disease-associated allele. Increasing availability and affordability of gene sequencing has led to the identification of multiple MEFV variants; however, they are often of unknown clinical significance. Variants in other genes affecting overlapping or distinct inflammatory signaling pathways - together with gene-environment interactions including epigenetic modulation - likely underlie the significant genetic and phenotypic heterogeneity seen among patients with this disease. We review recent evidence of the expanding spectrum of FMF genotype and phenotype and suggest that current drug funding schemes restricting biologic agents to patients with homozygous mutations have not kept pace with our biological understanding of the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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