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Enregistrement W2946774407 · doi:10.1002/ajp.22985

Small to modest impact of social group on the gut microbiome of wild Costa Rican capuchins in a seasonal forest

2019· article· en· W2946774407 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Primatology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesAlberta Children's Hospital Research InstituteAlberta Innovates - Technology FuturesCanada Research ChairsEppley Foundation for Research
Mots-clésBiologyMicrobiomeEcologyZoologyFecesTaxonDry seasonBeta diversityBiodiversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The horizontal transmission of pathogenic and beneficial microbes has implications for health and development of socially living animals. Social group is repeatedly implicated as an important predictor of gut microbiome structure among primates, with individuals in neighboring social groups exhibiting distinct microbiomes. Here we examine whether group membership is a predictor of gut microbiome structure and diversity across three groups of white-faced capuchins (Cebus capucinus imitator) inhabiting a seasonal Costa Rican forest. We collected 62 fecal samples from 18 adult females during four sampling bouts. Sampling bouts spanned the dry-to-wet-to-dry seasonal transitions. To investigate gut microbial composition, we sequenced the V4 region of the 16S rRNA gene. We used the DADA2 pipeline to assign amplicon sequence variants and the RDP database to classify taxa. Our findings are: 1) gut microbiomes of capuchins clustered by social group in the late dry season, but this pattern was less evident in other sampling bouts; 2) social group was a significant variable in a PERMANOVA test of beta diversity, but it accounted for less variation than season; 3) social group was not an important predictor of abundance for the ten most abundant microbial taxa in capuchins; 4) when examining log2-fold abundances of microbes between social groups, there were significant differences in some pairwise comparisons. While this is suggestive of group-wide differences, individual variation may have a strong impact and should be assessed in future studies. Overall, we found a minor impact of social group membership on the gut microbiota of wild white-faced capuchins. Future research including home range overlap and resource use, as well as fine-scale investigation of individual variation, will further elucidate patterns of socially structured microbes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,814
Score d'incertitude au seuil0,394

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle