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Enregistrement W2946803542 · doi:10.14785/lymphosign-2019-0006

Novel heterozygous <i>NFKB1</i> mutation in a pediatric patient with cytopenias, splenomegaly, and lymphadenopathy

2019· article· en· W2946803542 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.

Notice bibliographique

RevueLymphoSign Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCommon variable immunodeficiencyMissense mutationImmunologyMedicineImmune systemAntibodyMutationBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The nuclear factor κ-light-chain enhancer of activated B cells (NF-κB) signaling pathway is a critical regulator of many important adaptive and innate immune responses. The NF-κB transcription factor family consists of 5 structurally related core proteins, one of which is NFKB1. Mutations in the NFKB1 gene has been reported in patients with common variable immune deficiency (CVID) as well as with a large spectrum of clinical features including recurrent viral, bacterial, and fungal infections, autoimmunity, inflammation, and malignancy. Aim: We describe the clinical characteristics of a pediatric patient with a novel mutation in NFKB1. Methods: Patient informed consent was obtained in accordance with approved protocols from the Research Ethics Board at the Hospital for Sick Children. Gene panel testing was employed to identify the immune aberration. Results: Our patient, a previously well 18-month-old boy of Philippines descent, presented with multi-lineage cytopenias (thrombocytopenia, hemolytic anemia, neutropenia), splenomegaly, and lymphadenopathy. He did not have prior history of recurrent infections. Immunological work-up showed normal numbers of T and B cells, normal quantitative immunoglobulins, and adequate vaccination titres. Gene panel testing revealed a novel heterozygous missense variant c.425T&gt;C (p. Ile142Thr) in the NFKB1 gene. Due to persistent cytopenias unresponsive to steroids and IVIG, he was started on Sirolimus with improvement in symptoms. Conclusion: NFKB1 encodes for p105, which is processed to generate the active p50 transcription factor that can interact with different proteins to activate or inhibit downstream signaling. Our patient was found to have a missense mutation in the Rel homology domain (RHD) of p50, which has distinct functions including DNA binding, protein dimerization, and inhibitory protein binding. The clinical presentation described here broadens the scope of characteristics associated with heterozygous NFKB1 mutations. Statement of novelty: We report a novel heterozygous missense variant c.425T&gt;C (p. Ile142Thr) in the NFKB1 gene in a pediatric patient with cytopenias, lymphadenopathy, and splenomegaly. To the best of our knowledge, this variant has not been previously reported.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,184
Score d'incertitude au seuil0,719

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle