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Enregistrement W2946825671 · doi:10.1371/journal.pone.0216426

Intrinsic tumor necrosis factor-α pathway is activated in a subset of patients with focal segmental glomerulosclerosis

2019· article· en· W2946825671 sur OpenAlexafffund
Chen-Fang Chung, Thomas M. Kitzler, Nadezda Kachurina, Katarina Pessina, Sima Babayeva, Martin Bitzan, Frederic J Kaskel, Inés Colmegna, Nada Alachkar, Paul Goodyer, Andrey V. Cybulsky, Elena Torban

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Children's HospitalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesKidney Foundation of CanadaMcGill University Health CentreMcMaster University
Mots-clésFocal segmental glomerulosclerosisPodocyteNephrotic syndromeMedicineInternal medicinePathogenesisGlomerulonephritisEndocrinologyKidneyProteinuria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Focal segmental glomerulosclerosis (FSGS) is frequently found in biopsies of patients with steroid resistant nephrotic syndrome (SRNS). The pathogenesis of SRNS/FSGS is often unknown and the disease will recur in up to 50% of patients post-transplant, indicating the presence of circulating podocyte-toxic factor(s). Several studies have reported clinical improvement after anti-TNFα therapy. However, prediction of the clinical outcome in SRNS/FSGS is difficult, and novel predictive biomarkers are needed. An image-based assay, which measures disassembly of focal adhesion complexes in cultured podocytes, was used to ascertain the presence of podocyte toxic activity in SRNS/FSGS sera. Expression of TNFα pathway genes was analysed in the Nephroseq FSGS cohort and in cultured podocytes treated with SRNS/FSGS sera. Podocyte toxic activity was detected in 48/96 SRNS/FSGS patients. It did not correlate with serum TNFα levels, age, sex, ethnicity or glomerular filtration rate. In ~25% of the toxic samples, the toxicity was strongly inhibited by blockade of TNFα signaling. Transcriptional profiling of human FSGS biopsies and podocytes treated with FSGS sera revealed significant increases in expression of TNFα pathway genes. We identified patients with serum podocyte toxic activity who may be at risk for FSGS recurrence, and those patients in whom serum podocyte toxicity may be reversed by TNFα blockade. Activation of TNFα pathway genes occurs in podocytes of FSGS patients suggesting a causative effect of this pathway in response to circulating factor(s). In vitro analyses of patient sera may stratify patients according to prognostic outcomes and potential responses to specific clinical interventions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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