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Enregistrement W2946933084 · doi:10.1111/bjd.18165

Electron microscopy in the diagnosis of Ehlers–Danlos syndromes: correlation with clinical and genetic investigations

2019· article· en· W2946933084 sur OpenAlexaff
Chloe Angwin, Neeti Ghali, Duncan Baker, Angela F. Brady, F. Michael Pope, Anthony Vandersteen, Bart Wagner, David Ferguson, Fleur S. van Dijk

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Dermatology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensIzaak Walton Killam Health Centre
Organismes subventionnairesNorth-West University
Mots-clésEhlers–Danlos syndromeMedicinePathologyDermatology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The Ehlers-Danlos syndromes (EDS) consist of 13 subtypes with overlapping features including joint hypermobility, skin and vascular fragility and generalized connective tissue friability. As DNA analysis has become the gold standard for investigation of EDS, transmission electron microscopy (TEM) in clinical practice is decreasing. However, owing to the use of next-generation sequencing, the frequency of variants of uncertain significance (VUS) identified using DNA analysis is increasing. We hypothesized that TEM can provide evidence for or against pathogenicity of VUS. OBJECTIVES: The aim of this study was to evaluate the role of TEM in the diagnosis of EDS subtypes. METHODS: Data were collected from patients who underwent a skin biopsy between October 2012 and March 2017 at the London EDS National Diagnostic Service. TEM biopsies were categorized as 'normal' or 'abnormal' according to the description and conclusion in the TEM reports. Definitive diagnoses were reached via a combination of clinical features, structural and functional studies and DNA investigations. RESULTS: The analysis included 177 patients, comprising 30 abnormal and 147 normal TEM reports. A definitive diagnosis of monogenic EDS subtypes was made in 24 patients. Overall, 17 of these 24 patients (71%) had an abnormal biopsy report and seven (29%) had a normal biopsy report. No TEM findings were specifically associated with any EDS subtype, although collagen flowers were present in most patients with a genetically confirmed diagnosis of classical EDS. CONCLUSIONS: TEM analysis of collagen structure may have the potential to provide evidence for or against the pathogenicity of a VUS, but more work is needed to establish a clear role for TEM in this process. What's already known about this topic? Collagen fibril abnormalities can be seen in several Ehlers-Danlos syndrome (EDS) subtypes. What does this study add? This study provides clinical data, transmission electron microscopy (TEM) data and molecular data of one of the largest groups of patients suspected to have a monogenetic EDS subtype. No TEM findings were specifically associated with an EDS subtype. There was a higher percentage (71%) of abnormal biopsy findings in patients with a definitive diagnosis of a monogenetic EDS subtype and where a class 4/5 genetic variant was present.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,221

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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