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Enregistrement W2947049630 · doi:10.1186/s13223-019-0340-7

Variants in the IL17 pathway genes are associated with atopic asthma and atopy makers in a South American population

2019· article· en· W2947049630 sur OpenAlexvenueno aff
Milca de Jesus Silva, Maria Borges Rabêlo de Santana, Bruna Ramos Tosta, Roberta P. Espinheira, Neuza Maria Alcântara‐Neves, Maurício L. Barreto, Camila Alexandrina Figueiredo, Ryan dos Santos Costa

Notice bibliographique

RevueAllergy Asthma and Clinical Immunology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAtopyAsthmaImmunologyGenotypingAlleleImmunoglobulin EGeneBiologyMedicineGeneticsGenotypeAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Asthma is a complex disorder with multiple phenotypes which can influence its severity and response to treatment. The T H 17 lymphocytes producing IL-17A and IL17-F cytokines, may have a role on asthma inflammation. The aim of our study was to evaluate the association between genetic variants in IL17 pathway genes with asthma and atopy markers. Genotyping was performed using a commercial panel in 1245 participants of SCAALA cohort. The study included 91 SNVs in IL-17 pathway genes. Logistic regressions for asthma and atopy markers were performed using PLINK 1.9. In silico analyses were performed using rSNPbase, RegulomeDB, and Gtex portal for in silico gene expression. The T allele of rs1974226 in IL17A was positively associated with asthma (OR: 1.37; 95% CI 1.02–1.82). Also, the T allele of rs279548 was positively associated with asthma (OR: 1.30; 95% CI 1.02–1.64), atopy (OR: 1.62; 95% CI 1.05–2.50) and increased expression of the IL17RC in lung and whole blood tissues. The others genetic variants in the IL 17 pathways genes were associated with both protection and risk for asthma development as well as with IgE levels. The genetic variants in IL-17-related genes are associated with the atopic asthma phenotype and IgE production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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