Variants in the IL17 pathway genes are associated with atopic asthma and atopy makers in a South American population
Notice bibliographique
Résumé
Asthma is a complex disorder with multiple phenotypes which can influence its severity and response to treatment. The T H 17 lymphocytes producing IL-17A and IL17-F cytokines, may have a role on asthma inflammation. The aim of our study was to evaluate the association between genetic variants in IL17 pathway genes with asthma and atopy markers. Genotyping was performed using a commercial panel in 1245 participants of SCAALA cohort. The study included 91 SNVs in IL-17 pathway genes. Logistic regressions for asthma and atopy markers were performed using PLINK 1.9. In silico analyses were performed using rSNPbase, RegulomeDB, and Gtex portal for in silico gene expression. The T allele of rs1974226 in IL17A was positively associated with asthma (OR: 1.37; 95% CI 1.02–1.82). Also, the T allele of rs279548 was positively associated with asthma (OR: 1.30; 95% CI 1.02–1.64), atopy (OR: 1.62; 95% CI 1.05–2.50) and increased expression of the IL17RC in lung and whole blood tissues. The others genetic variants in the IL 17 pathways genes were associated with both protection and risk for asthma development as well as with IgE levels. The genetic variants in IL-17-related genes are associated with the atopic asthma phenotype and IgE production.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».