Analyses of rRNA gene chromatin in cell cycle arrested Saccharomyces cerevisiae cells
Notice bibliographique
Résumé
The existence of two chromatin structures in the rDNA locus was previously demonstrated for a large variety of organisms, ranging from yeast to human. In yeast there are about 150–200 rRNA genes organized in tandem repeats. Almost half of them are transcribed and largely depleted of nucleosomes (active/open), the other half is not transcribed and is assembled in regular arrays of nucleosomes (inactive/closed). It is proposed that RNA polymerase-I (RNAPI) transcription-elongation removes nucleosomes from closed rRNA genes (opening), and that soon after DNA replication there is deposition of nucleosomes on the open rRNA genes (closing). In G1 arrested cells, nearly all rRNA genes are depleted of nucleosomes, but most of them are not transcribed (inactive/open). In relation to the research article by Charton et al. (Mutat. Res.), the data presented here are on the hydroxyurea concentration-dependent inhibition of yeast culture growth, on cell cycle arrest before completion of genome replication, and on the opening of rRNA gene chromatin. As comparison, data are presented for yeast arrested in the G1-phase of the cell cycle by the pheromone α-factor.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».