Follow-up evaluation of outliers with elevated spermine-spermidine acetyltransferase-1 activity.
Notice bibliographique
Résumé
e14536 Background: In the evolving role of biomarkers, proteinomic signatures related to up-regulation of polyamine synthesis including spermine/spermidine acetyltransferase-1 (SSAT-1) appear to be promising markers of malignancy. Acetylamantadine (AA) excretion, a measure of SSAT-1 up-regulation, has been shown to be a marker for malignant proliferation. In preliminary analyses of ostensibly normal individuals from Canada (Winnipeg) and Bangladesh (Dhaka), a proportion were identified to have evidence of SSAT-1 up-regulation above the expected non-malignant range (outliers). These outliers were assessed and followed for development of identifiable medical conditions. Methods: SSAT-1 up regulation was assessed in 60 ostensibly normal individuals by analysis of urinary excretion of AA after ingestion of amantadine 200 mg x 1 dose. AA was assayed using HPLC-mass spec techniques as previously described. Outliers who consented were followed-up by clinical examinations, routine biochemical and hematological tests and radiographs, where indicated. Results: Total AA average (median) excretion at 6 hrs in the Winnipeg cohort was 579+/-252 vs 1699+/-633 ng in the Dhaka cohort. Average urinary concentration at 6 hrs was 3.75+/-0.75 vs 21+/-20 ng/ml. In outliers consenting to follow-up, 1 case of invasive malignancy was identified, 6 cases of pre-malignant neoplastic change, chronic liver disease in 7 cases and chronic inflammation in 2 cases. In others, no malignant or inflammatory conditions have yet been identified. The range of SSAT-1 activity in individuals living in Bangladesh was significantly higher than in the Canadian cohort. Bangladesh volunteers live in an area of known to have high natural contamination with arsenic, a recognized carcinogen and they are exposed to high levels of air pollution. Conclusions: By this assay, high SSAT-1 activity has been confirmed in patients harbouring malignancy; however, pre-malignant and inflammatory conditions may result in a positive test. Follow-up of individuals with elevated SSAT-1 activity may reveal unrecognized malignancies, pre-malignant neoplasms, liver disease, inflammatory conditions and possibly false-positivity in individuals exposed to carcinogens such as arsenic. In further work, SSAT-1 up-regulation is being correlated with 5 other putative polyamine metabolite markers for accurate diagnosis of lung cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».