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Enregistrement W2947200151 · doi:10.1186/s13223-019-0343-4

Stability of peripheral blood immune markers in patients with asthma

2019· article· en· W2947200151 sur OpenAlexafffundvenueabout
Nami Shrestha Palikhe, Ana-Maria Bosonea, Cheryl R. Laratta, Vivek Gandhi, Drew Nahirney, Angela Hillaby, Miranda Bowen, Mohit Bhutani, Irvin Mayers, Lisa Cameron, Harissios Vliagoftis

Notice bibliographique

RevueAllergy Asthma and Clinical Immunology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensWestern UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchReseau canadien de recherche respiratoire
Mots-clésAsthmaMedicineSpirometryImmunologyEosinophilPeripheral bloodImmune systemInternal medicineFlow cytometryPeripheralPeripheral blood cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Asthma is a complex disease with variable course. Efforts to identify biomarkers to predict asthma severity, the course of disease and response to treatment have not been very successful so far. We have previous suggested that PAR-2 and CRTh2 expression on specific peripheral blood cell subtypes may be biomarkers of asthma severity. We reasoned that parameters that remain stable when asthma symptoms are controlled would be the most appropriate to evaluate for their utility to predict loss of asthma control and/or severity of the disease. METHODS: Nineteen stable asthmatics were recruited from the University of Alberta Asthma clinic and followed in clinic every 3 months for a total of 4 visits. Patients had spirometry and completed the ACQ questionnaire in every visit. Blood was drawn in every visit and analyzed for a number of immune parameters by flow cytometry. These parameters included PAR-2 and CRTh2 expression on monocyte subgroups and T lymphocytes respectively, as well as numbers of eosinophils, innate lymphoid type-2 cells (ILC2) and dendritic cells. Within person stability of immune and physiological parameters was calculated using the intraclass correlation (ICC) using R version 3.4.0. RESULTS: /FVC ratio, ACQ5 and ACQ7 did not differ significantly over the 4 visits, as would be expected for patients with stable asthma. Peripheral blood eosinophil numbers by Kimura stain and by flow cytometry showed ICC scores of 0.44 and 0.52 respectively, indicating moderate stability. The % of ILC2 cells in peripheral blood also showed moderate stability [ICC score of 0.45 (0.14-0.67)]. The stability for all other immune parameters was poor. CONCLUSION: Among the peripheral blood immune parameters we studied, only numbers of eosinophils and ILC2 in peripheral blood were moderately stable over a year in stable asthmatics. Further studies are required to understand the reasons for the variability of the other cell types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2019
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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