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Enregistrement W2947230221 · doi:10.1111/nph.15970

The long and short of the <i>S</i> ‐locus in <i>Turnera</i> (Passifloraceae)

2019· article· en· W2947230221 sur OpenAlexafffund
Joel S. Shore, Hasan Hamam, Paul D. J. Chafe, Jonathan D. J. Labonne, Paige M. Henning, Andrew G. McCubbin

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Science Foundation
Mots-clésBiologyGeneticsGeneLocus (genetics)MutantHaplotypeGenomeAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Distyly is an intriguing floral adaptation that increases pollen transfer precision and restricts inbreeding. It has been a model system in evolutionary biology since Darwin. Although the S-locus determines the long- and short-styled morphs, the genes were unknown in Turnera. We have now identified these genes. We used deletion mapping to identify, and then sequence, BAC clones and genome scaffolds to construct S/s haplotypes. We investigated candidate gene expression, hemizygosity, and used mutants, to explore gene function. The s-haplotype possessed 21 genes collinear with a region of chromosome 7 of grape. The S-haplotype possessed three additional genes and two inversions. TsSPH1 was expressed in filaments and anthers, TsYUC6 in anthers and TsBAHD in pistils. Long-homostyle mutants did not possess TsBAHD and a short-homostyle mutant did not express TsSPH1. Three hemizygous genes appear to determine S-morph characteristics in T. subulata. Hemizygosity is common to all distylous species investigated, yet the genes differ. The pistil candidate gene, TsBAHD, differs from that of Primula, but both may inactivate brassinosteroids causing short styles. TsYUC6 is involved in auxin synthesis and likely determines pollen characteristics. TsSPH1 is likely involved in filament elongation. We propose an incompatibility mechanism involving TsYUC6 and TsBAHD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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