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Enregistrement W2947236019 · doi:10.1038/s41588-018-0321-7

New genetic signals for lung function highlight pathways and chronic obstructive pulmonary disease associations across multiple ancestries

2019· review· en· W2947236019 sur OpenAlexaff
Nick Shrine, Anna L. Guyatt, A. Mesut Erzurumluoglu, Victoria E. Jackson, Brian D. Hobbs, Carl Melbourne, Chiara Batini, Katherine A. Fawcett, Kijoung Song, Phuwanat Sakornsakolpat, Xingnan Li, Ruth Boxall, Nicola Reeve, Ma’en Obeidat, Jing Hua Zhao, Matthias Wielscher, Stefan Weiß, Katherine A. Kentistou, James P. Cook, Benjamin B. Sun, Jian Zhou, Jennie Hui, Stefan Karrasch, Medea Imboden, Sarah E. Harris, Jonathan Marten, Stefan Enroth, Shona M. Kerr, Ida Surakka, Véronique Vitart, Terho Lehtimäki, Richard J. Allen, Per Bakke, Terri H. Beaty, Eugene R. Bleecker, Yohan Bossé, Corry‐Anke Brandsma, Zhengming Chen, James D. Crapo, John Danesh, Dawn L. DeMeo, Frank Dudbridge, Ralf Ewert, Christian Gieger, Amund Gulsvik, Anna Hansell, Ke Hao, Joshua Hoffman, John E. Hokanson, Georg Homuth, Peter K. Joshi, Philippe Joubert, Claudia Langenberg, Xuan Li, Liming Li, Kuang Lin, Lars Lind, Nicholas Locantore, Jian’an Luan, Anubha Mahajan, Joseph Maranville, Alison D. Murray, David C. Nickle, Richard Packer, Margaret M. Parker, Megan L. Paynton, David J. Porteous, Dmitry Prokopenko, Dandi Qiao, Rajesh Rawal, Heiko Runz, Ian Sayers, Don D. Sin, Blair H. Smith, María Soler Artigas, David Sparrow, Ruth Tal‐Singer, Paul R. H. J. Timmers, Maarten van den Berge, John C. Whittaker, Prescott G. Woodruff, Laura M. Yerges-Armstrong, Olga G. Troyanskaya, Olli Raitakari, Mika Kähönen, Ozren Polašek, Ulf Gyllensten, Igor Rudan, Ian J. Deary, Nicole Probst‐Hensch, Holger Schulz, James F. Wilson, Beate Stubbe, Eleftheria Zeggini, Marjo‐Riitta Järvelin, Edwin K. Silverman, Caroline Hayward, Andrew P. Morris, Adam S. Butterworth, Robert A. Scott, Robin Walters, Deborah A. Meyers, Michael H. Cho, David P. Strachan, Ian P. Hall, Martin D. Tobin, Louise V. Wain

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2019
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) Research
Établissements canadiensInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecUniversité LavalSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNIHR Nottingham Biomedical Research CentreNIHR Leicester Biomedical Research CentreEconomic and Social Research CouncilBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilUniversity of LeicesterNational Institutes of HealthUppsala UniversitetNational Heart, Lung, and Blood InstituteBritish Lung FoundationVetenskapsrådetHjärt-LungfondenNational Institute for Health and Care ResearchBundesministerium für Bildung und ForschungDeutsche ForschungsgemeinschaftBritish Heart FoundationWellcome Trust
Mots-clésPhenomeCOPDGenome-wide association studyBiologyLung functionGeneralizability theoryGenetic associationPulmonary diseaseDiseaseLungBioinformaticsPhenotypeMedicineGeneticsInternal medicineGeneSingle-nucleotide polymorphismGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations599
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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