Cohort profile: Development and profile of a population-based, retrospective cohort of diagnosed people living with HIV in Ontario, Canada (Ontario HIV Laboratory Cohort)
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: Population-based cohorts of diagnosed people living with HIV (PLWH) are limited worldwide. In Ontario, linked HIV diagnostic and viral load (VL) test databases are centralised and contain laboratory data commonly used to measure engagement in HIV care. We used these linked databases to create a population-based, retrospective cohort of diagnosed PLWH in Ontario, Canada. PARTICIPANTS: A datamart was created by integrating diagnostic and VL databases and linking records at the individual level. These databases contain information on laboratory test results and sociodemographic/clinical information collected on requisition/surveillance forms. Datamart individuals enter our cohort with the first record of a nominal HIV-positive diagnostic test (1985-2015) or VL test (1996-2015), and remain unless administratively lost to follow-up (LTFU; no VL test for >2 years and no VL test in later years). Non-nominal diagnostic tests are excluded as they lack identifying information to permit linkage to other tests. However, individuals diagnosed non-nominally are included in the cohort with record of a VL test. The LTFU rule is applied to indirectly censor for death/out-migration. FINDINGS TO DATE: As of the end of 2015, the datamart contained 40 372 HIV-positive diagnostic tests and 23 851 individuals with ≥1 VL test. Almost half (46.3%) of the diagnostic tests were non-nominal and excluded, although this was lower (~15%) in recent years. Overall, 29 587 individuals have entered the cohort-contributing 229 302 person-years of follow-up since 1996. Between 2000 and 2015, the number of diagnosed PLWH (cohort individuals not LTFU) increased from 8859 to 16 110, and the percent who were aged ≥45 years increased from 29.1% to 62.6%. The percent of diagnosed PLWH who were virally suppressed (<200 copies/mL) increased from 40.7% in 2000 to 79.5% in 2015. FUTURE PLANS: We plan to conduct further analyses of HIV care engagement and link to administrative databases with information on death, migration, physician billing claims and prescriptions. Linkage to other data sources will address cohort limitations and expand research opportunities.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».