Transcriptional reference map of hormone responses in wheat spikes
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Phytohormones are key regulators of plant growth, development, and signalling networks involved in responses to diverse biotic and abiotic stresses. Transcriptional reference maps of hormone responses have been reported for several model plant species such as Arabidopsis thaliana, Oryza sativa, and Brachypodium distachyon. However, because of species differences and the complexity of the wheat genome, these transcriptome data are not appropriate reference material for wheat studies. RESULTS: We comprehensively analysed the transcriptomic responses in wheat spikes to seven phytohormones, including indole acetic acid (IAA), gibberellic acid (GA), abscisic acid (ABA), ethylene (ET), cytokinin (CK), salicylic acid (SA), and methyl jasmonic acid (MeJA). A total of 3386 genes were differentially expressed at 24 h after the hormone treatments. Furthermore, 22.7% of these genes exhibited overlapping transcriptional responses for at least two hormones, implying there is crosstalk among phytohormones. We subsequently identified genes with expression levels that were significantly and differentially induced by a specific phytohormone (i.e., hormone-specific responses). The data for these hormone-responsive genes were then compared with the transcriptome data for wheat spikes exposed to biotic (Fusarium head blight) and abiotic (water deficit) stresses. CONCLUSION: Our data were used to develop a transcriptional reference map of hormone responses in wheat spikes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».