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Enregistrement W2947588340 · doi:10.1186/s13578-019-0292-0

Caspase-11, a specific sensor for intracellular lipopolysaccharide recognition, mediates the non-canonical inflammatory pathway of pyroptosis

2019· review· en· W2947588340 sur OpenAlexaff
Xiaoli Huang, Yang Feng, Guanqing Xiong, Shona K. Whyte, Jing Duan, Yucen Yang, Kaiyu Wang, Shiyong Yang, Yi Geng, Yangping Ou, Defang Chen

Notice bibliographique

RevueCell & Bioscience · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammasome and immune disorders
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesApplied Basic Research Key Project of Yunnan
Mots-clésPyroptosisCell biologyCaspase 1CaspaseLipopolysaccharideInflammationInnate immune systemProgrammed cell deathBiologyChemistryInflammasomeApoptosisImmunologyBiochemistryImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pyroptosis, a type of programmed cell death that along with inflammation, is mainly regulated by two main pathways, cysteinyl aspartate specific proteinase (caspase)-1-induced canonical inflammatory pathway and caspase-11-induced non-canonical inflammatory pathway. The non-canonical inflammatory pathway-induced pyroptosis is a unique immune response in response to gram-negative (G − ) bacteria. It is induced by lipopolysaccharide (LPS) on the surface of G − bacteria. This activates caspase-11 which, in turn, activates a series of downstream proteins eventually forming protein pores on the cell membrane and inducing cell sacrificial processes. Caspase-11 belongs to the caspase family and is an homologous protein of caspase-1. It has the ability to specifically hydrolyze proteins, but it is still unclear how it regulates cell death caused by non-canonical inflammatory pathways. The present study describes a pathway that enables LPS to directly enter the cell and activate caspase-11, and the key role caspase-11 plays in the activation of pyroptosis and inflammation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations92
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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