MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2947624441 · doi:10.1186/s13073-019-0646-6

Points-to-consider on the return of results in epigenetic research

2019· review· en· W2947624441 sur OpenAlexafffund
Stephanie O. M. Dyke, Katie M. Saulnier, Charles Dupras, Amy P. Webster, Karen J. Maschke, Mark A. Rothstein, Reiner Siebert, Jörn Walter, Stephan Beck, Tomi Pastinen, Yann Joly

Notice bibliographique

RevueGenome Medicine · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensMcGill University and Génome Québec Innovation CentreMcGill University
Organismes subventionnairesSpace Operations Mission DirectorateUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustBundesministerium für Bildung und ForschungUniversity College LondonCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchGenome CanadaDepartment of Health and Social CareGovernment of CanadaMcGill University
Mots-clésWorkgroupEpigeneticsBioethicsEpigenomeEpigenomicsMedicineGeneticsBiologyComputer scienceDNA methylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As epigenetic studies become more common and lead to new insights into health and disease, the return of individual epigenetic results to research participants, in particular in large-scale epigenomic studies, will be of growing importance. Members of the International Human Epigenome Consortium (IHEC) Bioethics Workgroup considered the potential ethical, legal, and social issues (ELSI) involved in returning epigenetic research results and incidental findings in order to produce a set of 'Points-to-consider' (P-t-C) for the epigenetics research community. These P-t-C draw on existing guidance on the return of genetic research results, while also integrating the IHEC Bioethics Workgroup's ELSI research on and discussion of the issues associated with epigenetic data as well as the experience of a return of results pilot study by the Personal Genome Project UK (PGP-UK). Major challenges include how to determine the clinical validity and actionability of epigenetic results, and considerations related to environmental exposures and epigenetic marks, including circumstances warranting the sharing of results with family members and third parties. Interdisciplinary collaboration and good public communication regarding epigenetic risk will be important to advance the return of results framework for epigenetic science.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,021
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,035
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,991
Score d'incertitude au seuil0,111

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0210,035
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,005
Communication savante0,0040,007
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0090,012
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,188
Tête enseignante GPT0,435
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGenome MedicineMême sujetEpigenetics and DNA MethylationTravaux en français237 207