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Enregistrement W2947692488 · doi:10.1371/journal.pone.0217392

The human brain somatostatin interactome: SST binds selectively to P-type family ATPases

2019· article· en· W2947692488 sur OpenAlexafffund
Michael Solarski, Declan Williams, Mohadeseh Mehrabian, Hansen Wang, Holger Wille, Gerold Schmitt‐Ulms

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversity of AlbertaDiscovery CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesAlberta Prion Research Institute
Mots-clésInteractomeSomatostatinSomatostatin receptorChemistryBiochemistryPeptideBiologyReceptorBiophysicsEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Somatostatin (SST) is a cyclic peptide that is understood to inhibit the release of hormones and neurotransmitters from a variety of cells by binding to one of five canonical G protein-coupled SST receptors (SSTR1 to SSTR5). Recently, SST was also observed to interact with the amyloid beta (Aβ) peptide and affect its aggregation kinetics, raising the possibility that it may bind other brain proteins. Here we report on an SST interactome analysis that made use of human brain extracts as biological source material and incorporated advanced mass spectrometry workflows for the relative quantitation of SST binding proteins. The analysis revealed SST to predominantly bind several members of the P-type family of ATPases. Subsequent validation experiments confirmed an interaction between SST and the sodium-potassium pump (Na+/K+-ATPase) and identified a tryptophan residue within SST as critical for binding. Functional analyses in three different cell lines indicated that SST might negatively modulate the K+ uptake rate of the Na+/K+-ATPase.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,328

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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