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Enregistrement W2947704836 · doi:10.1186/s12886-019-1038-9

HOXA9 is a novel myopia risk gene

2019· article· en· W2947704836 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueBMC Ophthalmology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOphthalmology and Visual Impairment Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBeef Cattle Research Council
Mots-clésMedicineGeneOptometryOphthalmologyBioinformaticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: A recent meta-analysis revealed PAX6 as a risk gene for myopia. There is a link between PAX6 and HOXA9. Furthermore, HOXA9 has been reported to activate TGF-β that is a risk factor for myopia. We speculate HOXA9 may participate in myopia development. METHODS: The Singapore GUSTO birth cohort provides data on children's cycloplegic refraction measured at age of 3 years and their methylation profile based on the umbilical cord DNA. The HOXA9 expression levels were measured in the eyes of mono-ocular form deprivation myopia in mice. The plasmid with the mouse HOXA9 cDNA was constructed and then transfected to mouse primary retinal pigment epithelial (RPE) cells. The expression levels of myopia-related genes and cell proliferation were measured in the HOXA9-overexpressed RPE cells. RESULTS: A total of 519 children had data on methylation profile and cycloplegic refraction. The mean spherical equivalent refraction (SE) was 0.90D. Among 8 SE outliers (worse than -2D), 7 children had HOXA9 hypomethylation. The HOXA9 levels in the retina of myopic eyes was 2.65-fold (p = 0.029; paired t-test) higher than the uncovered fellow eyes. When HOXA9 was over-expressed in the RPE cells, TGF-β, MMP2, FGF2 and IGF1R expression levels were dose-dependently increased by HOXA9. However, over-expression of HOXA9 had no significant influence on IGF1 or HGF expression. In addition, HOXA9 also increased RPE proliferation. CONCLUSION: Based on the human, animal and cellular data, the transcription factor HOXA9 may promote the expression of pro-myopia genes and RPE proliferation, which eventually contribute to myopia development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnellow
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnellow
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle