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Enregistrement W2947788704 · doi:10.1200/jco.2019.37.15_suppl.9076

Identification and use of treatment (tx) options in patients (pts) with advanced non-small cell lung cancer (aNSCLC) after comprehensive genomic profiling (CGP): A real-world study.

2019· article· en· W2947788704 sur OpenAlexaff
Céline Mascaux, Lukas Bubendorf, Fabrice Barlési, James W. Clendening, Qing Zhang, Kieran Mace, Ádám Gondos, Stefan Foser, Lisa I. Wang, Luis Paz‐Ares

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensRoche (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineLung cancerClinical trialInternal medicineProfiling (computer programming)Oncology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

9076 Background: The number of targeted txs for NSCLC is increasing. By analyzing numerous molecular alterations, CGP may open more targeted tx options than single biomarker testing. Methods: We analyzed a database linking Flatiron Health electronic health record-based clinical and Foundation Medicine, Inc. (FMI) CGP genomic alteration (GA) data in US pts diagnosed from 1/2011 with aNSCLC, primarily from community practices, and with follow-up through 6/2018. We examined the prevalence and distribution of genomic findings, and agreement between tx received and CGP-directed tx options (approved for aNSCLC/other tumors) on the FMI report as a measure of clinical utility. The latter was evaluated in a subset of pts with sufficient tx and follow-up data after FMI testing. Results: Among 5112 FMI-tested pts (first test observed 8/2012), 49% had their FMI test before starting any line of tx, 97% had ≥ 1 GA with known/likely function (median = 5), and 85% had ≥ 1 potential tx option (52% had ≥ 1 option for aNSCLC and 33% had ≥ 1 for another tumor type only). In 1366 pts evaluable for tx agreement after FMI testing, 572 (42%) received a tx listed on the FMI report and 111 (8%) were enrolled in clinical trials. Pts with a tx option approved for aNSCLC were more likely to have a tx agreeing with an option on the FMI report (67% of 754) v pts with a tx option approved in another tumor type only (8% of 612). Among the 1366 pts, 14% had EGFR/ALK/ROS1/BRAF (EARB) tx options only. The remaining 1170 had a non-EARB tx option, either as their only option (1014; 87%), or in addition to an EARB tx option (156; 13%). The non-EARB tx options included 377 pts (32%) with a tumor mutational burden-associated tx option. In these 1170 pts, 341 (29%) had an agreeing tx besides EARB, and 100 (9%) were enrolled on trials. Conclusions: FMI CGP identified potential NSCLC-specific tx options/a clinical trial opportunity for 52% of pts with aNSCLC. Of the pts evaluated for tx agreement, almost ½ received a tx agreeing with an option on the FMI report and/or were enrolled in a clinical trial. FMI CGP adds value beyond single biomarker testing by identifying txs and trial options in a meaningful proportion of pts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,372
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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