Prospective cohort study of the impact of hospital-wide dihydropyrimidine dehydrogenase (<i>DPYD)</i> genotype testing for fluoropyrimidine-based chemotherapy on adverse events and hospital costs.
Notice bibliographique
Résumé
3028 Background: Fluoropyrimidines remain integral components of modern chemotherapy for solid tumors, and their toxicities can be reduced by pretreatment DPYD genotyping. Our main objective was to demonstrate the feasibility of implementing a hospital-wide pretreatment DPYD testing service based on the CPIC 2013 guideline on fluoropyrimidines and DPYD. Methods: We enrolled participants prior to planned fluoropyrimidine treatment as well as those who had experienced adverse events (AEs) after initiation of therapy, from December 1, 2013 to November 30, 2018. The patients tested pretreatment were analyzed as a prospective cohort to assess AEs within 90 days of fluoropyrimidine initiation and associated hospital cost. The primary outcome was the rate of severe global fluoropyrimidine-related toxicity in the pretreatment cohort (grade≥3, CTCAE v.4.0.3). Results: Of 1362 patients genotyped for DPYD within the study period 1041 were enrolled pretreatment and included in the primary analysis. The median age was 65 years (19-90), 57% male, 51% 5-FU, and 49% capecitabine. Dose reductions were recommended for 21 DPYD variant carriers who were detected pretreatment. There was no significant difference in the primary outcome between DPYD variant (29%) and wild type (18%) patients (Fisher’s exact test p = 0.25). Costs associated with ER visits and hospitalizations at our tertiary care centre were $1,268 (89-8,562) (Median (IQR)) and $2,961 (341-13,567) for DPYD variant (n = 4) and wild-type (n = 99) patients respectively. Post-AE genotyping (n = 70) found five DPYD variant patients; all experienced grade≥3 toxicity, costs were $15,825 (10,962-25,310), and one poor metabolizer died due to complications. Targeted next generation exome sequencing of DPYD wild-type patients who experienced severe AEs identified five potentially deleterious genetic variants in ABC efflux transporters. Conclusions: Pretreatment DPYD genotype guided dosing of fluorouracil and capecitabine is feasible and benefits patients, health care providers, and hospitals. Our data supports adoption of pretreatment DPYD genotyping as a standard of care.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».