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Enregistrement W2947963522 · doi:10.14785/lymphosign-2019-0007

Chronic mucocutaneous candidiasis associated with a novel frameshift mutation in IL-17 receptor alpha

2019· article· en· W2947963522 sur OpenAlexaffvenue
Amiirah Aujnarain, Harjit Dadi, Daniele Merico, Amarilla B. Mandola

Notice bibliographique

RevueLymphoSign Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChronic mucocutaneous candidiasisFrameshift mutationMucocutaneous zoneCandida albicansMutationImmune systemBiologyImmunologyMedicineExome sequencingSanger sequencingGeneticsPathologyDiseaseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Chronic mucocutaneous candidiasis (CMCC) has traditionally encompassed endocrinopathy, autoimmunity, and infection of the skin, nails, oral and genital mucosa. It is typically caused by Candida albicans, an organism that is found to be commensal in healthy individuals. To date, most patients with CMCC have mutations in AIRE or STAT1. While chronic Candida spp. infection is a feature of multiple profound T cell deficiencies, it has also been identified in rare cases involving selective immune defects, including interleukin-17 receptor A (IL-17RA) deficiency. An association between Staphylococcus aureus infections and candidiasis due to IL-17RA deficiency has recently been proposed. Aim: We sought to identify the genetic defect in a patient presenting with recurrent oral thrush and S. aureus infections, but otherwise unremarkable immune workup. Methods: Whole exome sequencing and Sanger confirmation was performed, and protein expression analysis utilized to assess the impact of the genetic aberration. A comprehensive immune workup was completed to characterize any possible deficits in his immune system. Results: Next generation sequencing techniques identified a homozygous mutation in IL17RA, c.1696insAG, resulting in the frameshift mutation p.Q566fs. Western blot analysis confirmed the loss of IL-17RA expression. Conclusion: We describe here a novel frameshift mutation in IL17RA. Clinically, the patient was a diagnostic challenge as he did not present with a classic CMCC phenotype. This case emphasizes the importance of genetic analysis in patients presenting with recurrent infections. Statement of novelty: We identify a novel frameshift mutation in IL17RA in a patient presenting with recurrent bacterial and fungal mucocutaneous infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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