Functional Analysis of the PgCesA3 White Spruce Cellulose Synthase Gene Promoter in Secondary Xylem
Notice bibliographique
Résumé
Cellulose is an essential structural component of the plant cell wall. Its biosynthesis involves genes encoding cellulose synthase enzymes and a complex transcriptional regulatory network. Three cellulose synthases have been identified in conifers as being potentially involved in secondary cell wall biosynthesis because of their preferential expression in xylem tissues; however, no direct functional association has been made to date. In the present work, we characterized the white spruce (Picea glauca (Moench) Voss) cellulose synthase PgCesA3 gene and 5’ regulatory elements. Phylogenetic analysis showed that PgCesA1-3 genes grouped with secondary cell wall-associated Arabidopsis cellulose synthase genes, such as AtCesA8, AtCesA4, and AtCesA7. We produced transgenic spruce expressing the GUS reporter gene driven by the PgCesA3 promoter. We observed blue staining in differentiating xylem cells from stem and roots, and in foliar guard cells indicating that PgCesA3 is clearly involved in secondary cell wall biosynthesis. The promoter region sequence of PgCesA3 contained several putative MYB cis-regulatory elements including AC-I like motifs and secondary wall MYB-responsive element (SMRE); however, it lacked SMRE4, 7 and 8 that correspond to the sequences of AC-I, II and III. Based on these findings and results of previous transient trans-activation assays that identified interactions between the PgCesA3 promoter and different MYB transcription factors, we performed electrophoretic mobility shift assays (EMSA) with MYB recombinant proteins and cis-regulatory elements present in the PgCesA3 promoter. We found that PgMYB12 bound to a canonical AC-I element identified in the Pinus taeda PAL promoter and two AC-I like elements. We hypothesized that the PgMYB12 could regulate PgCesA3 in roots based on previous expression results. This functional study of PgCesA3 sequences and promoter opens the door for future studies on the interaction between PgMYBs and the PgCesA3 regulatory elements.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».