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Enregistrement W2948037821 · doi:10.1183/13993003.02126-2018

Donor human leukocyte antigen-G single nucleotide polymorphisms are associated with post-lung transplant mortality

2019· article· en· W2948037821 sur OpenAlexafffund
Julieta Lazarte, Jin Ma, Tereza Martinu, Liran Levy, William Klement, Matthew T. White, Jacob Pelling, Zehong Guan, S. Azad, Jussi Tikkanen, Vivek Rao, George Tomlinson, Diego Delgado, Shaf Keshavjee, S. Juvet

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive System and Pregnancy
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health NetworkToronto General Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismMedicineLung transplantationHuman leukocyte antigenBronchoalveolar lavageSNPImmunologyTransplantationProportional hazards modelHazard ratioInternal medicineGastroenterologyLungGenotypeAntigenBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human leukocyte antigen (HLA)-G is a non-classical HLA that inhibits immune responses. Its expression is modified by single nucleotide polymorphisms (SNPs), which are associated with transplant outcomes. Our aim was to investigate the association of donor and recipient HLA-G SNPs with chronic lung allograft dysfunction (CLAD) and mortality after lung transplantation. In this single-centre study, we examined 11 HLA-G SNPs in 345 consecutive recipients and 297 donors of a first bilateral lung transplant. A multivariable Cox proportional hazards model assessed associations of SNPs with death and CLAD. Transbronchial biopsies (TBBx) and bronchoalveolar lavage (BAL) samples were examined using quantitative PCR, ELISA and immunofluorescence. Over a median of 4.75 years, 142 patients (41%) developed CLAD; 170 (49%) died. Multivariable analysis revealed donor SNP +3142 (GG+CG versus CC) was associated with increased mortality (hazard ratio 1.78, 95% CI 1.12–2.84; p=0.015). In contrast, five donor SNPs, -201(CC), -716(TT), -56(CC), G*01:03(AA) and 14 bp INDEL, conferred reduced mortality risk. Specific donor–recipient SNP pairings reduced CLAD risk. Predominantly epithelial HLA-G expression was observed on TBBx without rejection. Soluble HLA-G was present in higher concentrations in the BAL samples of patients who later developed CLAD. Specific donor SNPs were associated with mortality risk after lung transplantation, while certain donor–recipient SNP pairings modulated CLAD risk. TBBx demonstrated predominantly epithelial, and therefore presumably donor-derived, HLA-G expression in keeping with these observations. This study is the first to demonstrate an effect of donor HLA-G SNPs on lung transplantation outcome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,481
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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