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Enregistrement W2948052688 · doi:10.1186/s40168-019-0701-y

Ruminal microbiome-host crosstalk stimulates the development of the ruminal epithelium in a lamb model

2019· article· en· W2948052688 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueMicrobiome · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of ChinaUniversity of Alberta
Mots-clésBiologyCrosstalkMicrobiomeEpitheliumMicrobiologyGeneticsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The development of the rumen is an important physiological challenge for young ruminants. Previous studies have shown that starter feeding can effectively facilitate the growth and development of the rumen in ruminants. However, the mechanism through which starter feeding stimulates the development of the rumen is not clear. Here, we performed an integrated analysis in ruminal microbiota and a host transcriptomic profile in a lamb model with the intervention of starter feed to understand the ruminal microbiome-host crosstalk in stimulating the development of the ruminal epithelium. RESULTS: Decreased ruminal pH and increased acetate and butyrate concentrations in the rumen, followed by increasing rumen organ index, were observed in lambs supplemented with starter. Using metagenome sequencing in combination with 16S rRNA and 18S rRNA gene amplicon sequencing, the results showed the abundance of acetate-producing Mitsuokella spp., lactate-producing Sharpea spp., lactate-utilizing Megasphaera spp., and Entodinium spp. was enriched in rumen microbial communities in the starter-feed group. The abundances of genes involved in sugar degradation were decreased in starter-feed lambs, but the GH13 encoding α-amylase was obviously increased. Rumen epithelial transcriptome analysis revealed that seven differentially expressed genes, including MAPK1, PIK3CB, TNFSF10, ITGA6, SNAI2, SAV1, and DLG, related to the cell growth module were upregulated, and BAD's promotion of cell death was downregulated. Correlation analysis revealed that the increase in the concentrations of acetate and butyrate significantly correlated with the expression of these genes, which indicates acetate and butyrate likely acted as important drivers in the ruminal microbiome-host crosstalk. CONCLUSIONS: The present study comprehensively describes the symbiotic relationship between the rumen microbiota and the host in lambs after starter feeding. Our data demonstrates that the microbiome-driven generation of acetate and butyrate mediated the growth-related genes' regulation of the growth-associated signalling pathway in the ruminal epithelium. These co-development networks regulated many physiological processes in the epithelium, including papillae morphology and rumen epithelial growth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,458
Score d'incertitude au seuil0,223

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle