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Enregistrement W2948115897 · doi:10.1371/journal.pone.0217206

Assessing systemic and non-systemic transmission risk of tick-borne encephalitis virus in Hungary

2019· article· en· W2948115897 sur OpenAlexaff
Kyeongah Nah, F. M. G. Magpantay, Ákos Bede‐Fazekas, Gergely Röst, Attila J. Trájer, Xiaotian Wu, Xue Zhang

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensQueen's UniversityYork University
Organismes subventionnairesNemzetgazdasági MinisztériumNational Natural Science Foundation of ChinaGlaxoSmithKline
Mots-clésEnzooticTransmission (telecommunications)TickEncephalitisBiologyIncidence (geometry)VirologyTick-borne encephalitisEnvironmental healthMedicineVirusComputer sciencePhysicsTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Estimating the tick-borne encephalitis (TBE) infection risk under substantial uncertainties of the vector abundance, environmental condition and human-tick interaction is important for evidence-informed public health intervention strategies. Estimating this risk is computationally challenging since the data we observe, i.e., the human incidence of TBE, is only the final outcome of the tick-host transmission and tick-human contact processes. The challenge also increases since the complex TBE virus (TBEV) transmission cycle involves the non-systemic route of transmission between co-feeding ticks. Here, we describe the hidden Markov transition process, using a novel TBEV transmission-human case reporting cascade model that couples the susceptible-infected compartmental model describing the TBEV transmission dynamics among ticks, animal hosts and humans, with the stochastic observation process of human TBE reporting given infection. By fitting human incidence data in Hungary to the transmission model, we estimate key parameters relevant to the tick-host interaction and tick-human transmission. We then use the parametrized cascade model to assess the transmission potential of TBEV in the enzootic cycle with respect to the climate change, and to evaluate the contribution of non-systemic transmission. We show that the TBEV transmission potential in the enzootic cycle has been increasing along with the increased temperature though the TBE human incidence has dropped since 1990s, emphasizing the importance of persistent public health interventions. By demonstrating that non-systemic transmission pathway is a significant factor in the transmission of TBEV in Hungary, we conclude that the risk of TBE infection will be highly underestimated if the non-systemic transmission route is neglected in the risk assessment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,205
Score d'incertitude au seuil0,648

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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