Genome-Wide Analysis of Low Dose Bisphenol-A (BPA) Exposure in Human Prostate Cells
Notice bibliographique
Résumé
Endocrine disrupting compounds (EDCs) have the potential to cause adverse effects on wild-life and human health. Two important EDCs are the synthetic estrogen 17α-ethynylestradiol (EE2) and bisphenol-A (BPA) both of which are xenoestrogens (XEs) as they bind the estrogen receptor and dis-rupt estrogen physiology in mammals and other vertebrates. In the recent years the influence of XEs on oncogenes, specifically in relation to breast and prostate cancer has been the subject of considerable study. METHODOLOGY: In this study, healthy primary human prostate epithelial cells (PrECs) were exposed to environmentally relevant concentrations of BPA (5nM and 25nM BPA) and interrogated using a whole genome microarray. RESULTS: Exposure to 5 and 25nM BPA resulted in 7,182 and 7,650 differentially expressed (DE) genes, respectively in treated PrECs. Exposure to EE2 had the greatest effect on the PrEC transcriptome (8,891 DE genes). CONCLUSION: We dissected and investigated the nature of the non-estrogenic gene signature associated with BPA with a focus on transcripts relevant to epigenetic modifications. The expression of transcripts encoding nuclear hormone receptors as well as histone and DNA methylation, modifying enzymes were significantly perturbed by exposure to BPA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».