354-OR: Physiologic Pathways in Pregnancy Glycemic Regulation Implicated through Genetic Clustering Analysis
Notice bibliographique
Résumé
Background: Genetic determinants of glycemic regulation in pregnancy are poorly understood. Methods: We studied 35 glycemia-related traits measured during pregnancy and 191 genetic variants identified in prior genome-wide association studies of type 2 diabetes (T2D) or gestational glycemia. Using linear regression, we quantified associations between glucose-raising alleles and traits measured in 582 women at 24-28 weeks gestation. We clustered traits and variants using Bayesian nonnegative matrix factorization (bNMF) to identify physiologic pathways involved in pregnancy glucose metabolism. Results: In a plurality of bNMF iterations (22/50), 5 clusters emerged, with highly weighted traits and loci suggesting distinct physiologic pathways. Cluster 1: reduced insulin secretory response (lower insulin/c-peptide, greater insulin sensitivity); loci included several known or suspected to affect beta-cell function (ABO, CDKN2B, SLC30A8, CDKN1B). Cluster 2: obesity-related hyperglycemia (higher percent body fat, BMI, fasting/post-load glucose); loci included known obesity/T2D loci (MCR4, FTO) and loci previously tied to beta-cell function that associated with higher glucose and greater adiposity pregnant women (MTNR1B, GLP2R). Cluster 3: insulin resistance (reduced insulin sensitivity, higher fasting insulin/c-peptide, greater insulin secretory response); loci included LYPLAL1 and ANKRD55 (known to harbor insulin resistance variants). Cluster 4 traits suggested reduced adiposity with post-load glucose intolerance. Cluster 5 traits suggested a favorable metabolic profile (lower cholesterol and glucose, higher disposition index and insulin sensitivity). Conclusion: Genetic variants can be grouped to identify physiologic mechanisms at play in gestational glycemic regulation. Associations between physiologically-informed variant clusters, gestational diabetes, and related perinatal outcomes await testing in well-powered cohorts. Disclosure C.E. Powe: None. M. Udler: None. C. Allard: None. J. Kim: None. P. Perron: None. L. Bouchard: None. J.C. Florez: None. M. Hivert: None. Funding American Diabetes Association/Pathway to Stop Diabetes (1-15-ACE-26 to M-F.H.); National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases (K23DK113218, K24DK110550); Robert Wood Johnson Foundation; Fonds de la recherche du Québec en santé
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».