Direct Cellularity Estimation on Breast Cancer Histopathology Images Using Transfer Learning
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Residual cancer burden (RCB) has been proposed to measure the postneoadjuvant breast cancer response. In the workflow of RCB assessment, estimation of cancer cellularity is a critical task, which is conventionally achieved by manually reviewing the hematoxylin and eosin- (H&E-) stained microscopic slides of cancer sections. In this work, we develop an automatic and direct method to estimate cellularity from histopathological image patches using deep feature representation, tree boosting, and support vector machine (SVM), avoiding the segmentation and classification of nuclei. Using a training set of 2394 patches and a test set of 185 patches, the estimations by our method show strong correlation to those by the human pathologists in terms of intraclass correlation (ICC) (0.94 with 95% CI of (0.93, 0.96)), Kendall's tau (0.83 with 95% CI of (0.79, 0.86)), and the prediction probability (0.93 with 95% CI of (0.91, 0.94)), compared to two other methods (ICC of 0.74 with 95% CI of (0.70, 0.77) and 0.83 with 95% CI of (0.79, 0.86)). Our method improves the accuracy and does not rely on annotations of individual nucleus.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle