Expression and allele frequencies of Thymic stromal lymphopoietin are a key factor of breast cancer risk
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Thymic stromal Lymphopoeitin (TSLP) is a key cytokine involved in inflammation and cancer progression. TSLP gene polymorphisms have been associated with increased susceptibility to cancer progression in different organs. We performed a control case study to examine the correlation of expression and polymorphisms of three nucleotides in TSLP with breast cancer (BC) risk in Saudi Arabian females. MATERIALS AND METHODS: The study was conducted on 116 healthy control subjects and 127 female patients with BC for the purpose of genotyping. Ten matching tissues provided data on immunohistochemistry to evaluate TSLP expression. Three SNPs (rs10043985, rs2289276, and rs3806933) were genotyped with TaqMan allelic discrimination assay. The patients' ages and estrogen receptor statuses were used to investigate the potential correlations between the different variations of TSLP genotypes and BC risk. RESULTS: BC tissues expressed positive immuno-staining for TSLP at a high rate compared to normal matching breast tissues. Malignant breast tumors exhibited higher TSLP expression than benign breast tumors. We also found that the rs3806933 (T) allele frequency decreased the risk of developing BC in the study population (OR = 0.356, p = 0.00027) significantly (0.356 times). Interestingly, statistical analysis revealed that the genotype mutant (AC) and the allele mutant (C) of rs10043985 within TSLP were significantly correlated with an increased BC risk (odds ratio [OR] = 4.762, confidence interval [CI] = 1.000-22.666, p = 0.03244; OR = 4.762, CI = 1.000-22.666, p = 0.03244; and OR = 4.575, CI = 0.975-21.464, p = 0.03516, respectively). In addition, the AC and AC + CC genotypes of TSLP rs10043985 were confirmed to be associated with an increased risk of BC risk in women aged above 48 years, compared with the AA genotype (AC and AC + CC vs. AA: OR = 9.468, CI = 0.493-181.768, p = 0.04537). CONCLUSION: The results reveal significant correlation between SNPs in TSLP and BC progression in Saudi Arabian female patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».