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Enregistrement W2949151573 · doi:10.12688/wellcomeopenres.12583.3

Meta-analysis of exome array data identifies six novel genetic loci for lung function

2018· preprint· en· W2949151573 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueWellcome Open Research · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal Respiratory Health Research
Établissements canadiensInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecUniversity of British ColumbiaUniversité LavalSt. Paul's HospitalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Human Genome Research InstituteBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNational Heart, Lung, and Blood InstituteChief Scientist Office, Scottish Government Health and Social Care DirectorateBundesministerium für Bildung und ForschungBundesamt für UmweltNational Institutes of HealthHjärt-LungfondenUniversität GreifswaldLungenliga SchweizHjartaverndChinese Society of Clinical OncologyBundesamt für GesundheitNovo Nordisk FondenMedical Research CouncilAbbott DiagnosticsCopenhagen Graduate School for Nanoscience and NanotechnologyNational Institute of General Medical SciencesLeids Universitair Medisch CentrumNovo NordiskNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekNational Center for Advancing Translational SciencesEconomic and Social Research CouncilÅke Wiberg StiftelseU.S. Department of Health and Human ServicesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungUniversiteit LeidenSvenska Sällskapet för Medicinsk ForskningUnderstanding SocietySteno Diabetes Center CopenhagenNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesEuropean CommissionNovo Nordisk Foundation Center for Basic Metabolic ResearchAcademy of FinlandNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesScottish Funding CouncilNHLBI Division of Intramural ResearchNational Institute on AgingVlaamse regeringNational Institute for Health and Care ResearchUniversity of EssexWellcome TrustScottish GovernmentZonMwJohns Hopkins UniversityRoyal Society of EdinburghRoyal SocietyNational Science FoundationVetenskapsrådetNational Institute of Nursing ResearchFreiwillige Akademische GesellschaftAge UKErasmus Medisch CentrumU.S. Environmental Protection Agency
Mots-clésBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<ns4:p><ns4:bold>Background:</ns4:bold> Over 90 regions of the genome have been associated with lung function to date, many of which have also been implicated in chronic obstructive pulmonary disease.</ns4:p><ns4:p> <ns4:bold>Methods:</ns4:bold> We carried out meta-analyses of exome array data and three lung function measures: forced expiratory volume in one second (FEV<ns4:sub>1</ns4:sub>), forced vital capacity (FVC) and the ratio of FEV<ns4:sub>1</ns4:sub> to FVC (FEV<ns4:sub>1</ns4:sub>/FVC). These analyses by the SpiroMeta and CHARGE consortia included 60,749 individuals of European ancestry from 23 studies, and 7,721 individuals of African Ancestry from 5 studies in the discovery stage, with follow-up in up to 111,556 independent individuals.</ns4:p><ns4:p> <ns4:bold>Results:</ns4:bold> We identified significant (P&lt;2·8x10<ns4:sup>-7</ns4:sup>) associations with six SNPs: a nonsynonymous variant in <ns4:italic>RPAP1</ns4:italic>, which is predicted to be damaging, three intronic SNPs (<ns4:italic>SEC24C, CASC17 </ns4:italic>and <ns4:italic>UQCC1</ns4:italic>) and two intergenic SNPs near to<ns4:italic> LY86 </ns4:italic>and <ns4:italic>FGF10.</ns4:italic> Expression quantitative trait loci analyses found evidence for regulation of gene expression at three signals and implicated several genes, including <ns4:italic>TYRO3</ns4:italic> and <ns4:italic>PLAU</ns4:italic>.</ns4:p><ns4:p> <ns4:bold>Conclusions: </ns4:bold>Further interrogation of these loci could provide greater understanding of the determinants of lung function and pulmonary disease.</ns4:p>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,022
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Science ouverte, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesScience ouverte
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,460
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0220,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0070,013
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,687
Tête enseignante GPT0,554
Écart entre enseignants0,133 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle