MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2949455562 · doi:10.1186/s12870-019-1868-x

Improving the blast resistance of the elite rice variety Kongyu-131 by updating the pi21 locus

2019· article· en· W2949455562 sur OpenAlexfundno aff
Xiaomin Feng, Kangxue Lin, Wenqi Zhang, Jianzong Nan, Xiaohui Zhang, Chen Wang, Rongsheng Wang, Guoqiang Jiang, Qingbo Yuan, Shaoyang Lin

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsUniversity of Chinese Academy of SciencesInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of Sciences
Mots-clésBiologyQuantitative trait locusLocus (genetics)IndelPopulationGeneticsJaponicaGeneGenotypeSingle-nucleotide polymorphismBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: As an elite japonica rice variety, Kongyu-131 has been cultivated for over 20 years in the third accumulated temperature zone of Heilongjiang Province, China. However, the cultivated area of Kongyu-131 has decreased each year due to extensive outbreaks of rice blast. To achieve the goals of improving blast resistance and preserving other desirable traits in Kongyu-131, a genome-updating method similar to repairing a bug in a computer program was adopted in this study. A new allele of the broad-spectrum blast resistance gene pi21 in the upland rice variety GKGH was mined by genetic analysis and introgressed into the genome of Kongyu-131 to upgrade its blast resistance. RESULT: population derived from a cross between Kongyu-131 and GKGH, and a blast resistance QTL was detected near the pi21 locus. Parental Pi21 sequence alignment showed that the pi21 of the donor (GKGH) was a new allele. By 5 InDel or SNP markers designed based on the sequence within and around pi21, the introgressed chromosome segment was shortened to less than 634 kb to minimize linkage drag by screening recombinants in the target region. The RRPG was 99.92%, calculated according to 201 SNP markers evenly distributed on 12 chromosomes. Artificial inoculation at the seedling stage showed that the blast resistance of the new Kongyu-131 was improved significantly. Field experiments also indicated that the improved Kongyu-131 had enhanced field resistance to rice blast and grain-quality traits similar to those of the original Kongyu-131. CONCLUSIONS: It is feasible to improve resistance to rice blast and preserve other desirable traits by precisely improving the Pi21 locus of Kongyu-131. Linkage drag can be eliminated effectively via recombinant selection on both sides of the target gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,601
Score d'incertitude au seuil0,253

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBMC Plant BiologyMême sujetGenetic Mapping and Diversity in Plants and AnimalsTravaux en français237 207