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Enregistrement W2949541642 · doi:10.1101/157966

SHP2 Is Required for BCR-ABL1-Induced Hematologic Neoplasms

2017· preprint· en· W2949541642 sur OpenAlexafffund
Shengqing Gu, Azin Sayad, Gordon Chan, Wentian Yang, Zhibin Lu, Carl Virtanen, Richard A. Van Etten, Benjamin G. Neel

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Myeloid Leukemia Treatments
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthPrincess Margaret Cancer Foundation
Mots-clésCancer researchPhiladelphia chromosomeTyrosine kinaseMyeloid leukemiaABLbreakpoint cluster regionBiologyLeukemiaMAPK/ERK pathwayMyeloidKinaseSignal transductionImmunologyCell biologyGeneticsReceptorChromosomal translocation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract BCR-ABL1-targeting tyrosine kinase inhibitors (TKIs) have revolutionized treatment of Philadelphia chromosome-positive (Ph + ) hematologic neoplasms. Nevertheless, acquired TKI resistance remains a major problem in chronic myeloid leukemia (CML), and TKIs are less effective against Ph + B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL). GAB2, a scaffolding adaptor that binds and activates SHP2, is essential for leukemogenesis by BCR-ABL1, and a GAB2 mutant lacking SHP2 binding cannot mediate leukemogenesis. Using a genetic loss-of-function approach and bone marrow transplantation (BMT) models for CML and BCR-ABL1 + B-ALL, we show that SHP2 is required for BCR-ABL1-evoked myeloid and lymphoid neoplasia. Ptpn11 deletion impairs initiation and maintenance of CML-like myeloproliferative neoplasm, and compromises induction of BCR-ABL1 + B-ALL. SHP2, and specifically, its SH2 domains, PTP activity and C-terminal tyrosines, is essential for BCR-ABL1 + , but not WT, pre-B cell proliferation. The MEK/ERK pathway is regulated by SHP2 in WT and BCR-ABL1 + pre-B cells, but is only required for the proliferation of BCR-ABL1 + cells. SHP2 is required for SRC family kinase (SFK) activation only in BCR-ABL1 + pre-B cells. RNAseq reveals distinct SHP2-dependent transcriptional programs in BCR-ABL1 + and WT pre-B cells. Our results suggest that SHP2, via SFKs and ERK, represses MXD3/4 to facilitate a MYC-dependent proliferation program in BCR-ABL1-transformed pre-B cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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