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Enregistrement W2949560690 · doi:10.1098/rsos.180999

Multiple exposures, reinfection and risk of progression to active tuberculosis

2019· article· en· W2949560690 sur OpenAlexafffundabout
Sarah F. Ackley, Robyn S. Lee, Lee Worden, Erin Zwick, Travis C. Porco, Marcel A. Behr, Caitlin S. Pepperell

Notice bibliographique

RevueRoyal Society Open Science · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesU.S. National Library of MedicineNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésTuberculosisActive tuberculosisMedicineMycobacterium tuberculosisBiologyVirologyImmunologyEnvironmental healthPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A recent study reported on a tuberculosis (TB) outbreak in a largely Inuit village. Among newly infected individuals, exposure to additional active cases was associated with an increasing probability of developing active disease within a year. Using binomial risk models, we evaluated two potential mechanisms by which multiple infections during the first year following initial infection could account for increasing disease risk with increasing exposures. In the reinfection model , each infectious contact confers an independent risk of an infection, and infections contribute independently to active disease. In the threshold model , disease risk follows a sigmoidal function with small numbers of infectious contacts conferring a low risk of active disease and large numbers of contacts conferring a high risk. To determine the dynamic impact of reinfection during the early phase of infection, we performed simulations from a modified Reed–Frost model of TB dynamics following spread from an initial number of cases. We parametrized this model with the maximum-likelihood estimates from the reinfection and threshold models in addition to the observed distribution of exposures among new infections. We find that both models can plausibly account for the observed increase in disease risk with increasing infectious contacts, but the threshold model confers a better fit than a nested model without a threshold ( p = 0.04). Our simulations indicate that multiple exposures to infectious individuals during this critical time period can lead to dramatic increases in outbreak size. In order to decrease TB burden in high-prevalence settings, it may be necessary to implement measures aimed at preventing repeated exposures, in addition to preventing primary infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,391

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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