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Enregistrement W2949676553 · doi:10.1152/ajpcell.00096.2019

Wide field of view quantitative imaging of cellular ATP release

2019· article· en· W2949676553 sur OpenAlexafffund
Ju Jing Tan, Olga Ponomarchuk, Ryszard Grygorczyk, Francis Boudreault

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Cell Physiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMechanosensitive channelsPopulationExtracellularBiophysicsStrain (injury)SecretionTonicityChemistryCell biologyBiologyBiochemistryAnatomyMedicineReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although several mechanical stressors promote ATP secretion from eukaryotic cells, few mechanosensitive pathways for ATP release have been precisely characterized and none have been clearly identified. To facilitate progress, we report here a wide field of view (∼20 × 20 mm sample area) imaging technique paired with a quantitative image analysis to accurately map the dynamics of ATP release from a cell population. The approach has been tested on A549 cells stretched at high initial strain rate (2–5 s−1) or swelled by hypotonic shock. The amount of ATP secreted in response to a series of five graded stretch pulses (5–37% linear deformation, 1-s duration at 25°C) changed nonmonotonically with respect to strain amplitude and was inhomogeneous across the cell monolayer. In a typical experiment, extracellular ATP density averaged 250 fmol/mm2, but the area of detectable signal covered only ∼40% of the cells. In some areas, ATP accumulation peaked around 900 fmol/mm2, which corresponded to an estimated concentration of 4.5 µM. The total amount of ATP released from the combined stretch pulses reached 384 ± 224 pmol/million cells ( n = 4). Compared with stretch, hypotonic shock (50%, 30°C) elicited a more homogeneous ATP secretion from the entire cell population but at a lower yield totaling 28 ± 12 pmol/million cells ( n = 4). The quantitative extracellular ATP mapping of several thousand cells at once, with this wide field of view imaging system, will help identify ATP release pathways by providing unique insights on the dynamics and inhomogeneities of the cellular ATP secretion that are otherwise difficult to assess within the smaller field of view of a microscope.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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