Maternal proteins that are phospho-regulated upon egg activation include crucial factors for oogenesis, egg activation and embryogenesis in <i>Drosophila melanogaster</i>
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Egg activation is essential for the successful transition from a mature oocyte to a developmentally competent egg. It consists of a series of events including the resumption and completion of meiosis, initiation of translation of some maternal mRNAs and destruction of others, and changes to the vitelline envelope. This drastic change of cell state is accompanied by large scale alteration of the phospho-proteome of the cell. Despite the importance of this transition in cell and developmental state, it has been difficult to find many of its regulators. We hypothesize that phosphorylation state changes between oocyte and early embryo regulate the activities of proteins that are necessary during or after this transition, and thus that the set of phospho-regulated proteins would be an enriched source for finding critical players in the egg-to-embryo transition. To test this, we used germline-specific RNAi to examine the function of 189 maternal proteins that are phospho-regulated during egg activation in Drosophila melanogaster . We identified 53 genes whose knockdown reduced or abolished egg production, as well as 50 genes for which maternal knockdown led to significant impairment or abolishment of the eggs’ ability to hatch (hatchability). We observed different stages of developmental arrest in the embryos with impaired hatchability and several distinct categories of abnormalities in the maternal knockdown embryos that arrest early in development, suggesting potential roles of the candidates in egg activation and early embryogenesis. Our results, validated by our detection of multiple genes with previously-documented maternal-effect phenotypes among the proteins we tested, revealed 15 genes with new roles in egg activation and early embryogenesis. Given that protein phospho-regulation also occurs during this transition in other organisms, we suggest that the phospho-regulated proteins may provide an enriched dataset for identifying important players in the egg-to-embryo transition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».