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Enregistrement W2949732894 · doi:10.1128/jvi.00895-18

Susceptibility to Neutralization by Broadly Neutralizing Antibodies Generally Correlates with Infected Cell Binding for a Panel of Clade B HIV Reactivated from Latent Reservoirs

2018· article· en· W2949732894 sur OpenAlexaff
Yanqin Ren, Maria Korom, Ronald Truong, Dora Chan, Szu-Han Huang, Colin Kovacs, Erika Benko, Jeffrey T. Safrit, Hermes Garbán, Richard Apps, Harris Goldstein, Rebecca M. Lynch, R. Brad Jones

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMaple Leaf Medical Clinic
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of Mental HealthNational Institutes of HealthamfAR, The Foundation for AIDS Research
Mots-clésNeutralizationVirologyAntibodyBiologyVirusImmune systemHuman immunodeficiency virus (HIV)Immunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although antiretroviral therapies have improved the lives of people who are living with HIV, they do not cure infection. Efforts are being directed towards harnessing the immune system to eliminate the virus that persists, potentially resulting in virus-free remission without medication. HIV-specific antibodies hold promise for such therapies owing to their ability to both prevent the infection of new cells (neutralization) and direct the killing of infected cells. We isolated 36 HIV strains from individuals whose virus was suppressed by medication and tested 14 different antibodies for neutralization of these viruses and for binding to cells infected with the same viruses (critical for engaging natural killer cells). For both neutralization and infected cell binding, we observed variation both between individuals and amongst different viruses within an individual. For most antibodies, neutralization activity correlated with infected cell binding. These data provide guidance on the selection of antibodies for clinical trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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