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Enregistrement W2949754698 · doi:10.1200/jco.2012.30.15_suppl.5010

Molecular determinants of outcome with mTOR inhibition in endometrial cancer (EC).

2012· article· en· W2949754698 sur OpenAlexaff
Helen Mackay, Elizabeth A. Eisenhauer, Suzanne Kamel‐Reid, Blaise Clarke, Wendy Walsh, Katherine Karakasis, Helga B. Salvesen, Amit M. Oza

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal cell carcinoma treatment
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPTENKRASNeuroblastoma RAS viral oncogene homologMedicineTemsirolimusPI3K/AKT/mTOR pathwayCancer researchSelumetinibPDGFRAOncologyInternal medicineCDKN2ACancerDiscovery and development of mTOR inhibitorsGeneticsBiologySignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

5010 Background: Deregulation of PI3K/AKT/mTOR signaling plays a significant role in EC biology. NCIC CTG has completed three phase II trials of 2 mTOR inhibitors (temsirolimus and ridaforolimus) in EC (IND 160A, IND 160B, IND192) demonstrating anti-tumor activity. PTEN expression, however, was not associated with response. In this study we are conducting additional molecular analyses on samples obtained from patients (pts) participating in these trials to identify mutations or other findings associated with mTOR response. Methods: Formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tumor samples were collected from pts treated on the three trials. Tumor DNA was isolated and mutational profiling (MP) was performed using theOncoCarta Panel v1.0 which can detect 238 mutations in 19 oncogenes including AKT1, 2, BRAF, CDK-4, EGFR, ERBB2, MET, H-, K-, N- RAS, PDGFRA, PIK3CA, RET. All mutations were verified by Sanger sequencing. For each gene found to be mutated in at least 1 patient, the relationship between presence/absence of mutations in that gene and objective anti-tumor response (RR) was assessed (RR vs. no response; early progression (PD) vs. no PD) using Fisher's exact test. In addition, the presence of any mutation vs. no mutations was assessed in relationship to the same clinical outcomes. Results: MP was feasible in 73 of the 94 eligible pts treated on the three trials. 44% (32 pts) had a mutation in at least one gene: 21 pts (29%) in PIK3CA, 10 (14%) KRAS, 4 (5%) MET, 3 (4%) NRAS, 3 (4%) AKT and 1(1%) EGFR. 9 pts (12%) had > 1 mutation. No significant correlations were seen, in individual trials or within the pooled data set of 3 studies, between the presence/absence of any mutation and RR (p=1.0) or early PD (p=1.0). No significant association was seen between the presence of mutations within individual genes and RR or PD (including PIK3CA). Of interest, no response was observed in any of the 13 pts with a Ras mutation (non-significant). Additional analyses involving gene expression (including stathmin) and correlation of MP with tumor morphology are underway. Conclusions: Mutations are common in EC but we have not identified a statistical association between presence of mutations in PIK3CA or any other gene and response to mTOR inhibition. Further analyses are ongoing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,180
Tête enseignante GPT0,489
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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