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Enregistrement W2949782512 · doi:10.1016/j.dib.2019.104117

Data on changes of NF-κB gene expression in liver and lungs as a biomarker and hepatic injury in CLP-induced septic rats

2019· article· en· W2949782512 sur OpenAlexaff
Saba Miri, Azadeh Rasooli, Satinder Kaur Brar

Notice bibliographique

RevueData in Brief · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensYork UniversityInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiomarkerGene expressionMedicineSepsisPathologyInfiltration (HVAC)Real-time polymerase chain reactionReverse transcription polymerase chain reactionImmunologyGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nuclear factor kappa-light-chain-enhancer of activated B cells (NF-κB) is a ubiquitous transcription factor, which plays a key role in regulating immune response against infection. Increased and/or prolonged activation of NF-κB has been linked to cancer, inflammatory, autoimmune diseases and viral infection. The purpose of this set of data was to evaluate NF-κB gene expression in cecal ligation and puncture (CLP)- induced septic rats and associated hepatic cell changes. Here, we provide the information about the evaluation of NF-κB gene expression using Real-time PCR and histopathological data of liver-related to our study published in the Turkish Journal of Medical Sciences [1]. Also, the information of the primers and more details about gene expression evaluation by real-time PCR of the targeted gene is provided. The data present here introduced another biomarker in liver and lung of CLP- induced septic rats and also confirmed hepatic dysfunction based on the pathological data. The histopathologic assessment showed normal condition in control group, mild infiltration of neutrophils in the liver parenchyma and portal tracts in LAP group (laparotomy) but severe congestion, severe neutrophil infiltration in the liver parenchyma and portal tracts in the CLP group. The data from real-time PCR showed that NF-κB expression was significantly increased in the CLP group compared with the control and LAP group, so it can be a biomarker for (CLP)- induced sepsis. This set of data and our previous study underscored the powerful potential of using the real-time PCR method to determine the involvement of genes such as MPO, CD177, and NF-κB in infectious diseases like sepsis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,278
Score d'incertitude au seuil0,385

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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