Roles and regulation of «Saccharomyces cerevisiae» Rho-type GTPases Rho5p and Cdc42p
Notice bibliographique
Résumé
The eukaryotic Rho family of GTPases acts as central regulators of numerous processes, including the polarization of cell morphology, membrane transport, transcription, and MAPK pathway signaling. As GTPases, Rho proteins act as molecular switches which, in the GTP-bound form, transduce upstream signals to a variety of downstream effectors, thereby generating appropriate cellular responses. As central nodes of signaling, they are subject to strict regulation, and the regulation of the GTP-GDP cycle of Rho members has been well characterized. Rho GTPases participate in a variety of pathways, though in many cases the mechanisms are still poorly understood. This study examines the roles and regulation of two Rho GTPases in Saccharomyces cerevisiae, Rho5p and Cdc42p. First, we describe the regulation of Rho5p signaling by phosphorylation and ubiquitination, the first instance of post-translational regulation of a yeast Rho-type GTPase. This regulation is mediated by a module involving the Npr1p kinase and its inhibitor Msi1p. We also identify Rgd2p as the RhoGAP for Rho5p in vivo, and demonstrate a genetic interaction between RHO5 and STE50: a STE50 deletion combined with expression of an activated RHO5 allele results in osmotic sensitivity. Next, we describe a role for Rho5p in the activation of the cAMP-PKA pathway. Expression of an activated allele of RHO5 generates a number of phenotypes associated with activated cAMP-PKA pathway signaling, and also suppresses the lethality of a strain deleted for two other cAMP-PKA activators, Δras1 Δras2. A mechanism by which Rho5p may activate the pathway is suggested by the observed two-hybrid interaction between Rho5p and adeny
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».