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Enregistrement W2949839058 · doi:10.1016/j.ohx.2017.10.001

An open-source, programmable pneumatic setup for operation and automated control of single- and multi-layer microfluidic devices

2017· article· en· W2949839058 sur OpenAlexfundno aff
Kara Brower, Robert Puccinelli, Craig J. Markin, Tyler C. Shimko, Scott A. Longwell, Bianca Cruz, Rafael Gómez-Sjöberg, Polly M. Fordyce

Notice bibliographique

RevueHardwareX · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMicrofluidic and Capillary Electrophoresis Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCenter for Bioenergy InnovationNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchStanford UniversityArnold and Mabel Beckman FoundationCharles Babbage Institute, University of MinnesotaNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésMicrofluidicsOpen sourceEmbedded systemComputer hardwareComputer scienceLayer (electronics)Single usePneumatic flow controlNanotechnologyEngineeringMaterials scienceOperating systemSoftwareProcess engineeringMechanical engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

high-throughput biological measurement, fluid physics, laboratory fluid manipulation) but widespread adoption has been limited in part due to the lack of openly disseminated resources that enable non-specialist labs to make and operate their own devices. Here, we report the open-source build of a pneumatic setup capable of operating both single and multilayer (Quake-style) microfluidic devices with programmable scripting automation. This setup can operate both simple and complex devices with 48 device valve control inputs and 18 sample inputs, with modular design for easy expansion, at a fraction of the cost of similar commercial solutions. We present a detailed step-by-step guide to building the pneumatic instrumentation, as well as instructions for custom device operation using our software, Geppetto, through an easy-to-use GUI for live on-chip valve actuation and a scripting system for experiment automation. We show robust valve actuation with near real-time software feedback and demonstrate use of the setup for high-throughput biochemical measurements on-chip. This open-source setup will enable specialists and novices alike to run microfluidic devices easily in their own laboratories.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,055

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0160,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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