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Enregistrement W2949969572 · doi:10.1002/hon.4_2629

IDENTIFYING MUTATIONS ENRICHED IN RELAPSED‐REFRACTORY DLBCL TO DERIVE GENETIC FACTORS UNDERLYING TREATMENT RESISTANCE

2019· article· en· W2949969572 sur OpenAlexaff
Christopher Rushton, Miguel Alcaide, Matthew C. Cheung, Nicole Thomas, Sarah E. Arthur, Neil R. Michaud, Scott R. Daigle, Jordan Davidson, Kevin Bushell, Stephen Yu, Michael D. Jain, Lois E. Shepherd, Michael Crump, Koren K. Mann, John Kuruvilla, Sarit Assouline, Nathalie A. Johnson, Daniel Scott, Ryan D. Morin

Notice bibliographique

RevueHematological Oncology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreMcGill UniversityQueen's UniversityGenome British ColumbiaPrincess Margaret Cancer CentreSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOncologyDiffuse large B-cell lymphomaInternal medicineExome sequencingPopulationExomeMedicineLymphomaGermline mutationCohortMutationBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

around 30 distinct clinicopathological PTCL entities in the current WHO classification.Follicular helper T cells (TFH) appear as the cell counterpart of a major proportion of PTCL worldwide, including angio-immunoblastic T-cell lymphoma and other nodal lymphomas with a TFH phenotype; the later disclose a rather homogeneous mutational landscape which recapitulates a multi-step oncogenic process associating epigenetic deregulation (TET2 +/-DNMT3Amutations, often at early stages), and second hit mutations affecting the T-cell receptor signaling pathway (RHOA,..).This oncogenic model has been confirmed in mouse models and opens the field for using emerging epigenetic-or signalingmodulating therapies.Among anaplastic large cell lymphoma (ALCL), those with ALK rearrangement constitute the best-delineated entity.ALK-negative ALCLs appear genetically heterogeneous with translocation-associated subsets (DUSP22, TP63,…) found in both systemic and cutaneous types.DUSP22-rearranged ALK-negative ALCL likely constitutes a unique category with a distinct signature and a good outcome.Except for DUSP22-rearranged ALCL, a constitutive activation of STAT3 is shared by ALK-positive and ALK-negative ALCLs, including the newly described usually indolent breast implantassociated ALCL.Lymphomas derived from cells of the innate immune system affect preferentially extranodal sites, which are continuously exposed to various antigens.Chronic immunosuppression and genetic background may also play a role.There is evidence of plasticity in terms of cellular derivation (NK, Tγδ,Tαβ) within a single entity.Most of these tumors also harbor a combination of mutations affecting different classes of epigenetic modifyers, and mutation-induced activation of the JAK-STAT pathway which may serve as potential therapeutic targets.While most of these proliferations are highly malignant, some more indolent forms have been identified, arising in the skin or the GI tract.Despite significant progress in the understanding of PTCLs, 20-30% of PTCL patients remain "unspecified", a basket category which may contain emerging (GATA3 or T-bet) subtypes.Most PTCL probably harbor distinct therapeutic vulnerabilities supporting the need for biologically-oriented therapeutic strategies to improve patient's outcome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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