The global distribution of <i>Bacillus anthracis</i> and associated anthrax risk to humans, livestock, and wildlife
Notice bibliographique
Résumé
Summary Bacillus anthracis is a spore-forming, Gram-positive bacterium responsible for anthrax, an acute and commonly lethal infection that most significantly affects grazing livestock, wild ungulates and other herbivorous mammals, but also poses a serious threat to human health 1, 2 . The geographic extent of B. anthracis endemism is still poorly understood, despite multi-decade research on anthrax epizootic and epidemic dynamics around the world 3, 4 . Several biogeographic studies have focused on modeling environmental suitability for anthrax at local or national scales 5–9 , but many countries have limited or inadequate surveillance systems, even within known endemic regions. Here we compile an extensive global occurrence dataset for B. anthracis , drawing on confirmed human, livestock, and wildlife anthrax outbreaks. With these records, we use boosted regression trees 10, 11 to produce the first map of the global distribution of B. anthracis as a proxy for anthrax risk. Variable contributions to the model support pre-existing hypotheses that environmental suitability for B. anthracis depends most strongly on soil characteristics such as pH that affect spore persistence, and the extent of seasonal fluctuations in vegetation, which plays a key role in transmission for herbivores 12, 13 . We apply the global model to estimate that 1.83 billion people (95% credible interval: 0.59—4.16 billion) live within regions of anthrax risk, but most of that population faces little occupational exposure to anthrax. More informatively, a global total of 63.8 million rural poor livestock keepers (95% CI: 17.5—168.6 million) and 1.1 billion livestock (95% CI: 0.4—2.3 billion) live within vulnerable regions. Human risk is concentrated in rural areas, and human and livestock vulnerability are both concentrated in rainfed systems throughout arid and temperate land across Eurasia, Africa, and North America. We conclude by mapping where anthrax risk overlaps with vulnerable wild ungulate populations, and therefore could disrupt sensitive conservation efforts for species like bison, pronghorn, and saiga that coincide with anthrax-prone, mixed-agricultural landscapes. Anthrax is a zoonotic disease caused by the Gram-positive bacterium Bacillus anthracis , a generalist soil-transmitted pathogen found on every inhabited continent 14 , and several islands including Haiti and parts of the Philippines and Indonesia. Worldwide, an estimated 20,000 to 100,000 cases of anthrax occur annually, mostly in poor rural areas 15 . In clinical presentations of anthrax, case fatality rates are a function of exposure pathway. Respiratory exposure from spore inhalation is important the context of bioterrorism, but is highly uncommon, and accounts for a negligible fraction of the global burden of anthrax cases. Cutaneous exposure to B. anthracis accounts for the majority of human cases worldwide, and typically presents with low mortality; gastrointestinal exposure accounts for the remainder and presents with intermediate to high fatality rates. Cutaneous and gastrointestinal cases of anthrax are most commonly caused by handling and slaughtering infected livestock, or butchering and eating contaminated meat; untreated gastrointestinal cases likely account for most human mortality from anthrax. 14–16
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».