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Enregistrement W2950165587 · doi:10.1017/thg.2017.69

Copy Number Variation Analysis of 100 Twin Pairs Enriched for Neurodevelopmental Disorders

2018· article· en· W2950165587 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueTwin Research and Human Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchForskningsrådet om Hälsa, Arbetsliv och VälfärdHospital for Sick ChildrenVetenskapsrådetStockholms Läns LandstingKarolinska InstitutetUniversity of TorontoEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsSvenska Forskningsrådet FormasVINNOVAStiftelsen för Strategisk ForskningGlaxoSmithKlineSwedish Foundation for International Cooperation in Research and Higher EducationÅke Wiberg StiftelseHjärnfonden
Mots-clésCopy-number variationGeneticsBiologyConcordanceAutismMonozygotic twinStructural variationGeneGenomeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hundreds of penetrant risk loci have been identified across different neurodevelopmental disorders (NDDs), and these often involve rare (<1% frequency) copy number variations (CNVs), which can involve one or more genes. Monozygotic (MZ) twin pairs are long thought to share 100% of their genomic information. However, genetic differences in the form of postzygotic somatic variants have been reported recently both in typically developing (TD) and in clinically discordant MZ pairs. We sought to investigate the contribution of rare CNVs in 100 twin pairs enriched for NDD phenotypes with a particular focus on postzygotic CNVs in MZ pairs discordant for autism spectrum disorder (ASD) using the Illumina Infinium PsychArray. In our sample, no postzygotic de novo CNVs were found in 55 MZ twin pairs, including the 13 pairs discordant for ASD. We did detect a higher rate of CNVs overlapping genes involved in disorders of the nervous system, such as a rare deletion affecting HNRNPU, in MZ pairs discordant and concordant for ASD in comparison with TD pairs (p = .02). Our results are in concordance with earlier findings that postzygotic de novo CNV events are typically rare in genomic DNA derived from saliva or blood, and suggests that the discordance of NDDs in our sample of twins is not explained by discordant CNVs. Still, studies investigating postzygotic variation in MZ discordant twins using DNA from different tissues and single cells and higher resolution genomics are needed in the future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,425
Score d'incertitude au seuil0,407

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle